代建制是目前各地正在探索的一种新型建设管理模式，它能有效地实现投资、建设、管理、使用职能四者分离的目标。 政府投资工程具有建设规模大、投资多元化、建设周期长、不确定因素多、社会影响深远等特点，因此政府性工程应具有比一般工程更严格的管理程序和措施。对于政府投资工程中的风险因素，从事工程活动的主体一旦认识不足或者不能有效地加以控制，往往会遭到失败，特别是随着政府投资工程代建制管理模式的引入，规范和化解政府投资工程代建风险，将是一个关系到政府投资项目的目标能否达到，代建制工程管理模式的优势能否体现的重要问题。 本文从代建制工程管理模式的内涵、运作方式出发，应用现代项目风险管理的理论方法，对政府投资工程实施代建制的风险来源、影响因素进行了分析，建立了三层前馈神经网络模型，根据BP算法调整其权值和阀值，进行系统训练并结合输入数据，最终得到风险估计系数作为输出值作为决策依据，为政府投资工程的风险分析提供了一种结合现代算法的新思路。最后，论文提出了政府投资工程委托代建风险的控制和防范措施。