本试验利用8个微卫星座位分析了新疆三个地方(吐鲁番、喀什和伊犁)斗鸡类群的等位基因频率、多态信息含量、基因杂合度和有效等位基因数等群体遗传变异参数,研究结果如下:1、每一微卫星座位的等位基因频率在不同类群之间存在着明显的差异,表现出等位基因在各类群中的分布不平衡性。8个微卫星位点共检测到77个等位基因,平均基因数为9.63个。2、8个微卫星基因座中,MCW0157座位多态性最丰富,平均遗传杂合度为0.8569,ADL0298座位多态性最差,平均遗传杂合度为0.6723。3个斗鸡类群中,吐鲁番斗鸡遗传杂合度最高(0.8255),伊犁斗鸡遗传杂合度最低(0.7874)。3、8个微卫星座位在3个试验鸡中表现出较高的多态信息含量,均大于0.5,说明试验所用的8个微卫星座位均为高度多态,可作为有效的遗传标记用于鸡群体遗传多样性的分析。4、所有类群间的平均遗传距离为0.2886(0.2051～0.3859),其中吐鲁番斗鸡和喀什斗鸡之间的Ds遗传距离最近为0.2051,伊犁斗鸡和喀什斗鸡之间的Ds遗传距离最远为0.3859。5、运用SPSS13.0软件进行单因素方差分析并采用LSD法进行显著性检验(P<0.05表示差异显著,P<0.01表示差异极显著)分析新疆三个地方斗鸡的体尺性状的关系,发现吐鲁番斗鸡、喀什斗鸡和伊犁斗鸡在体尺方面差异显著或极显著。综上所述,8个微卫星基因座多态信息含量丰富,适合作为新疆3个斗鸡类群的遗传标记,可用于其多样性评估、遗传距离分析、性状选育等研究领域。新疆3个斗鸡类群遗传多态性丰富,遗传变异较大,均具有较大的遗传潜力,可依据其特有的基因型选育出各具特色的新疆3个地区斗鸡新品种(系)。