猪PRRSV BJ-10株主要结构蛋白质基因序列分析

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以美洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ATCC VR-2332株基因组序列为参照,利用Oligo4.0软件设计3对特异性引物,分段扩增PRRSV BJ-10株主要结构蛋白基因cDNA,并与pGEM-T Easy质粒载体连接.经转化、克隆筛选和特异性酶切鉴定,确证为阳性的重组质粒测序并按顺序进行拼接.将所得PRRSV BJ-10株主要结构蛋白基因与美洲型及欧洲型代表毒株相关序列比较结果显示:PRRSV BJ-10株与美洲型ATCC VR2332株更为相近,核苷酸序列及推导性氨基酸序列同源性分别为99﹪和97﹪,而与LV析汀差较远,核苷酸序列及推导性氨基酸序列同源性仅为68﹪和53﹪.此后将近PRRSV BJ-10株与同属美洲型的PRRSV BJ-4株、CH-1a株及美洲型代表株ATCC VR-2332株ORF5-7核苷酸序列及推导性氨基酸序列进行了分别比较分析,结果显示:ORF6最为保守,ORF5推导性氨基酸序列N端159位存在一处较为明显的变异,ORF7推导性氨基酸序列存在两处较为明为的变异,分别位于N端17位和93位.
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