人大肠癌相关EST-2的分子克隆及初步分析

来源 :中国人民解放军军医进修学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sherryholmes
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大肠癌(colorectal cancer,CRC)是人类高发恶性肿瘤之一,近年来其发病率和死亡率呈上升趋势。随着分子生物学的不断发展,肿瘤被确认为是一种基因病。癌基因的激活和抑癌基因的失活是其发生发展的内在本质。此外,一些细胞调控分子基因表达的异常也在致癌通路或促癌转移过程中发挥重要作用。随着后基因组时代的到来,国内外应用具有高度并行性、高通量、微型化和自动化特色的基因芯片技术对大肠癌基因表达谱进行了较多研究,使大肠癌相关基因库不断丰富。然而,这些研究仅限于基因表达谱数据的初步挖掘,对筛得的大肠癌相关基因缺乏后续的研究报道,未形成系统性研究。本课题是许红民等“不同分化程度大肠癌的基因表达谱分析”课题的延伸。许红民等首次应用美国Affymetrix公司制备的HG-U133原位合成寡核苷酸芯片(含迄今所知的人类全基因共32264个,包括19308个已知的人类基因和12956个EST簇)技术,以相应的正常大肠粘膜组织为对照,对不同分化程度大肠癌组织进行基因水平的系列研究,筛查得到一系列大肠癌差异表达基因及ESTs。其中,Affymetrix编号为244669_at的EST(本研究暂命名为CRC-EST2)在肿瘤组与正常组中的表达差异倍数为1.285759898,秩和检验两者呈显著性差异(P=0.04,<0.05);不同分化程度的大肠癌表达比较,高、中、低分化三组间的差异有统计学意义(F检验,P=0.0240,<0.05),提示该EST是大肠癌相关EST及大肠癌分化相关EST。本研究在此工作基础上,采用电子克隆及RACE技术,对CRC-EST2进行分子克隆,获取该EST基因全长,并与Genebank比对;应用反转录(reversetranscription followed by PCR,RT-PCR)技术和实时荧光定量PCR(real-timefluorescent quantitative PCR,Q-PCR)技术,检测其在大肠癌组织和正常组织中的表达及其量的差异。主要研究结果为:1、确认Affymetrix公司注录编号为244669 at的EST为Genebank中已注录的非蛋白编码基因(non-coding protein gene)U50HG(基因编号:AB017710)。2、验证了U50HG在10例大肠癌和6例正常粘膜组织中确有表达,与前期研究结果一致;测得该基因在大肠癌LoVo细胞系中亦有表达。3、测得U50HG在大肠癌组织呈高表达,大肠癌组织和正常粘膜组织表达水平的差异具有统计学意义(秩和检验,P=0.0393),证实了前期工作关于“其与大肠癌相关”的研究结果。有关U50HG可在大肠癌、大肠粘膜组织和大肠癌LoVo细胞系中表达,且为大肠癌相关基因的研究结果,文献未见报道。
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