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肝癌是的发病率和死亡率分别居恶性肿瘤第6和第3位。全球每年新发病例约62.6万,死亡约59.8万。深入研究肝癌的发病机制,了解其生物学特性,是寻找肝痛新的诊断标志物和治疗靶点的基础。
MicroRNA(miRNA)是一类长度为17~25个核苷酸的非编码小分子RNA,在转录后调节靶基因的表达,从而影响多种生物学功能。根据所调控靶基因功能的不同,miRNA具有抑癌基因和癌基因的双重作用。miRNA的表达谱与肿瘤的类型相关,不同类型的肿瘤具有明显相互区别的miRNA表达谱,提示miRNA可以作为肿瘤分类的标志物,并可用于肿瘤的治疗和预后判断。microRNA对靶基因的调节主要通过与靶基因的3非编码区互补结合(3-UTR),调控蛋白的翻译。其对细胞功能的调控与其调节的靶基因功能相关。
miR-106b属于miR-106b~25基因簇,由miR-106b、miR-93及miR-25组成,编码基因染色体定位于7q22.1。对不同组织来源的肿瘤miRNA表达谱分析发现,miR-106b在多种肿瘤组织及肿痛细胞株中都高表达,包括头颈部鳞癌、结肠癌、髓母细胞瘤、食管癌、多发性骨髓瘤、肝癌等。
Wnt/β-catenin(简称Wnt)信号传导通路是一条在生物进化中极为保守的通路。其中β-catenin是该通路的关键效应分子,正常情况下其在胞浆中含量很少,因为大量的β-catenin蛋白被axin/GSK-3/APC多蛋白复合物磷酸化后,通过泛蛋白化途径被降解。而当Wnt蛋白与细胞表面受体Frizzled结合后,受体激活Dishevelled家族蛋白,最终导致细胞巾β-catenin增加。胞浆中增加的β-catenin就可以进入细胞核,与TCF/LEF家族转录因子相互作用,促进特定基因表达。而在β-catenin含量调节中,APC蛋白起着非常重要的作用。APC基因(Adenomatouspolyposiscoli,APC)是家族性结肠息肉痛(falIlilyadenomatouspolyposis,FAP)以及散发性结肠痛的抑癌基因,该基因的突变与结肠癌、肺癌、胰腺癌、胃癌、食道癌的发生有密切关系。APC蛋白可与β-连环蛋白(β-catenin)连接,促进β-catenin降解,如果APC受到抑制,则β-catenin在细胞浆内积累,积累达一定量后,可进入细胞核,与T细胞因子TCF结合,促进相关基因的表达。因此APC被认为是一种抑癌基因,在多种细胞过程中起作用。APC的作用在调节Wnt/β-catenin信号通路中的作用非常重要。
因此在本研究中,我们通过检测miR-106b在肝细胞癌中的作用及机制。与正常肝组织和肝上皮细胞相比,肝癌组织和细胞株中miR-106b的表达显著升高。外源性表达miR-106b可促进细胞增殖,并引起细胞由G1期向S期转化;而抑制miR-106b则抑制细胞增殖,并引起G0/G1期阻滞。荧光素酶报告基因检测发现,miR-106b通过靶向Wnt/β-catenin信号通路中的APC基因,抑制APC基因表达,从而导致胞浆中β-catenin增加,并进入细胞核内,从而引起其下游基因,如cyclinD1和pRB的激活,促进细胞增殖。发现miR-106b通过靶向APC基因3-UTR,抑制APC基因的表达及Wnt/β-catenin信号通路的活性,促进HCC细胞的增殖。推测miR-106b在HCC的发生发展中起重要作用,其可以成为HCC治疗的一个新的潜在靶点,并可用于HCC治疗和预后,以及疾病监测的重要指标。
方法:
1.分析miR-106b在肝癌细胞株和肝癌组织中表达情况。首先采用Real-timePCR方法检测8个HCC细胞株(HepG2,QGY-7703,BEL-7402,MHCC97H,HCCC-9810,Hep3B,MHCC97L和Huh7细胞)与正常肝上皮细胞株(NLEC)中miR-106表达的差异;并选取8例HCC病例,检测肝癌组织和邻近非肿瘤组织中miR-106b表达的差异;并与NCBI/GEO中有关miR-106在肝癌中表达检测进行比对。
2.检测外源性表达miR-106b对HCC细胞增殖的影响。通过构建含有miR-106b的pcDNA3.1质粒,转染QGY-7703和HepG2细胞,在细胞中过表达miR-106b,应用MTT方法,检测miR-106b对细胞增殖速率的影响;应用克隆形成实验,检测miR-106b过表达对QGY-7703和HepG2细胞克隆形成能力的影响;应用软琼脂增殖实验,检测miR-106b过表达,对细胞不依赖锚定生长能力的影响,该不依赖锚定生长是恶性肿瘤迁徙性增强的显著标志。
3.检测miR-106b对HCC细胞周期的影响。应用BrdU掺入实验,检测在QGY-7703和HepG2细胞中过表达miR-106b,细胞新和成DNA的能力;应用流式细胞仪检测过表达miR-106b对细胞周期的影响,特别是对G1/S转变的影响。
4.抑制miR-106b对HCC细胞增殖的影响。构建miR-106b抑制序列,转染QGY-7703和HepG2细胞,同样应用MTT实验,克隆形成实验,以及软琼脂增殖实验,检测抑制miR-106b对HCC细胞增殖速率的影响。
5.检测抑制miR-106b对细胞周期的影响。检测抑制miR-106b对BrdU竞争性掺入的影响,并用流式细胞仪检测抑制miR-106b对细胞周期的影响。
6.miR-106b对cyclinD1,pRb细胞周期蛋白表达的影响。Westernblotting方法检测miR-106b过表达和抑制miR-106b表达对Wnt通路下游信号cyclinD1和pRb蛋白表达的影响;并应用Real-timePCR方法检测cyclinD1mRNA水平的改变,检测miR-106b对cyclinD1表达的影响。
7.TOP/FOP荧光素酶检测miR-106b对Wnt/β-catenin信号通路的影响。TOP/FOP荧光素酶检测是Wnt/β-catenin信号通路其下游TCF-4活性的经典试验。TOP/FOPFLASH质粒购自美国Milipore公司。检测miR-106b过表达和抑制miR-106b表达对TOP/FOP荧光比例的影响。
8.miR-106b对Wnt/β-catenin信号通路下游分子的影响。Real-timePCR方法检测Wnt/β-catenin信号通路下游调节靶基因MYC,CYR61,CD44,Snail,TCF4,RUNX2等的mRNA表达水平改变。
9.miR-106b对β-catenin在细胞内定位的影响。分离细胞浆和胞核蛋白,Westernblotting方法检测胞浆和胞核中β-catenin表达情况。以p84作为核蛋白标志,EF-1α作为蛋白上样标准。
10.抑制Wnt/β-catenin信号通路下游TCF4分子,对miR-106b在HCC细胞周期影响中的作用。流式细胞仪检测同时抑制TCF4和过表达miR-106b对HCC细胞周期的影响,进而检测抑制TCF4后,过表达miR-106b对细胞周期的影响。
11.miR-106b在HCC细胞中的直接作用靶点。经理论计算,miR-106b的靶分子是APC蛋白。Westernblotting方法检测过表达miR-106b和抑制miR-106b对APC蛋白表达的影响。并进一步检测miR-106b对APC的抑制是通过APC的3-UTR进行,我们将包含两个miR-106b结合位点的APC-3-UTR片段克隆到pEGFP-C3和pGL3双荧光素酶的报告载体中,检测AP.C-3-UTR片段对miR-106b过表达所引起的GFP表达的影响。并检测不同剂量的miR-106b过表达和抑制其表达,对荧光素酶表达的影响。进而构建APC-3-UTR片段的突变体,再次检测其对miR-106b过表达和抑制其表达后,对荧光表达的影响,以确定APC是否是miR-106b作用的直接靶点。
12.抑制APC表达,对miR-106b所致的细胞增殖和周期转变的影响。应用siRNA方法,沉默APC基因表达,再同时过表达miR-106b或抑制miR-106b,检测细胞周期,BrdU掺入实验的改变,探讨APC在miR-106b在诱导细胞增殖中的作用机制。
结果:
1.在HCC细胞株和HCC组织中,miR-106的表达显著上调。Real-timePCR结果显示,所研究的HCC细胞株与正常肝上皮细胞相比,miR-106b的表达都显著上调(各组增长倍数的99.375%置信区间均不包括1)。所有8例肝癌组织中,miR-106b的表达量与邻近的非肿瘤组织miR-106b的表达量的比值最小为5.767±0.513,说明在肝癌组织和肝癌细胞株中,miR-106b的表达上调,与NCBI/GEO/GSE31384研究结果一致。
2.外源性过表达miR-106b,促进细胞增殖。外源性过表达miR-106b,MTT结果显示,上调miR-106b显著增加QGY-7703和HepG2细胞的增殖速度(F=541.794,P=0.000)。克隆形成实验结果证实miR-106b上调促进HCC细胞{QGY-7703(t=26.704=0.000)和HepG2(t=21.992,P=0.000)细胞,}增殖的作用,差异有统计学意义(P<0.05)。软琼脂增殖实验显示,大于0.1mm的克隆数,HCC细胞{QGY-7703(t=18.614,P=0.000)和HepG2(t=16.444,P=0.000)细胞,}明显多于正常细胞,证实过表达miR-106b可以增强HCC细胞不依赖锚定生长的能力,可以促进肿瘤的转移和迁徙。而BrdU掺入实验结果提示,与对照组相比,QGY-7703细胞中过表达miR-106b,Brdu阳性细胞显著增高(t=12.518,P=0.000),可以显著增加S期细胞的比例,S期细胞比例从31.04%增加到57.22%;同样在HepG2细胞中得到相似结果,过表达miR-106b,Brdu阳性细胞显著增高(t=11.767,P=0.000),使S期细胞的比例从29.93%增加到56.76%。流式细胞仪检测结果与以上结果一致,过表达miR-106b,使得S期细胞比例显著上调,促进G1/S期转化,促进细胞增殖。
3.抑制miR-106b表达,则可抑制HCC细胞增殖。构建miR-106b抑制序列,在QGY-7703和HepG2细胞中抑制miR-106b的表达,MTT实验显示,QGY-7703细胞(t=10.354,P=0.000)和在HepG2细胞(t=8.136,P=0.000)中抑制miR-106b表达,可以显著抑制细胞的增殖速率。克隆形成实验显示,QGY-7703细胞(t=45.226,P=0.000)和HepG2细胞(t=54.177,P=0.000)中抑制miR-106b表达,可以显著抑制细胞的增殖速率。不依赖锚定生长能力检测结果提示,QGY-7703细胞(t=10.099,P=0.000)和HepG2细胞(t=10.123,P=0.000)中抑制miR-106b表达,显著抑制不依赖锚定生长能力,克隆形成的数目和体积都明显下降。
与此结果一致,BrdU掺入实验和流式细胞仪检测记过提示,抑制miR-106b的表达,QGY-7703细胞(t=8.539,P=0.000)和HepG2细胞(t=6.745,P=0.000)中Brdu阳性细胞明显降低,可以显著降低S期细胞的比例,抑制细胞新和成DNA的能力,并使得细胞产生G0/G1期阻滞。
4.miR-106b促进HCC细胞增殖通过激活Wnt/β-catenin信号通路实现。
TOP/FOP荧光素酶比例检测,是检测Wnt/β-catenin信号通路活性的经典实验,在本研究中发现,QGY-7703和HepG2细胞中过表达miR-106b,导致细胞中TOP/FOP荧光素酶表达比例显著升高(TOP/FOP荧光素酶比值的均值介于3.633~4.090之间,各组增长倍数的97.5%可信区间均不包括1);而抑制miR-106b表达,则抑制TOP/FOP荧光素酶表达比例(TOP/FOP荧光素酶比值的均值介于0.333~0.370之间,各组增长倍数的97.5%可信区间均不包括1),提示miR-106b的过表达可以激活Wnt/β-catenin信号通路。
同时应用Westernblotting方法检测Wnt/β-catenin信号通路下游的cyclinD1、pRb蛋白及其磷酸化形式的表达,结果显示:过表达miR-106b的肝癌细胞中cyclinD1、磷酸化pRb(p-pRb)表达水平上调;Real-timePCR结果显示,miR-106b提高cyclinD1的mRNA水平(转染miR-106b肝癌细胞cyclinD1的表达量与正常肝上皮细胞表达量比值的均值介于4.050~4.067之间,各组增长倍数的98.33%置信区间均不包括1);并且增加Wnt/β-catenin信号通路下游分子,如MYC,CYR61,CD44,Snail,TCF4,RUNX2的表达(转染miR-106b肝癌细胞巾6个经典靶基因的mRNA表达量与正常肝上皮细胞表达量比值的均值介于2.457~7.520之间,各组增长倍数的97.50%置信区间均不包括1)。
Wnt/β-catenin信号通路的激活,促进胞浆中β-catenin的积累,并促进其进入细胞核内,因此我们通过分离细胞浆和细胞核内蛋白,Westernblotting结果显示,过表达miR-106b,显著上调细胞核内β-catenin的表达;而抑制miR-106b的表达,则胞核中β-catenin的含量显著下降。
5.抑制Wnt/β-catenin信号通路下游关键分子TCF4,对miR-106b在HCC细胞中作用的影响。为了研究miR-106b对HCC细胞周期的调节作用是否通过激活Wnt/β-catenin信号通路产生,我们抑制Wnt/β-catenin信号通路下游的关键分子TCF4,结果提示,抑制TCF4,可以逆转miR-106b所引起的S期细胞比例增加,抑制细胞G1/S期转变。以上结果提示,miR-106b促进HCC细胞增殖,细胞周期G1/S期转化的作用是通过激活Wnt/β-catenin信号通路所实现的。
6.APC蛋白是miR-106b作用的直接靶点。APC蛋白在Wnt/β-catenin信号通路活性调节中发挥重要作用,为了研究miR-106b激活Wnt/β-catenin信号通路的机制,我们分析了miR-106b可能的作用靶点,计算结果提示,APC蛋白的3-UTR片段与miR-106b互补,提示APC可能是miR-106b的作用靶点。
实验验证中首先我们检测miR-106b对APC蛋白表达的影响,Westernblotting结果显示,过表达miR-106b显著抑制APC蛋白的表达,而抑制miR-106b的表达,则APC的表达上调。双荧光素酶报告载体显示,miR-106b仅抑制包含APC-3-UTR载体的GFP荧光表达提示miR-106b特异地靶向APC的3-UTR,从而下调APC的表达。
7.miR-106b直接靶向APC基因的3-UTR,抑制APC基因的表达。构建含有miR-106结合位点的APC基因3-UTR片段的GFP表达质粒,结果提示,miR-106b可以抑制APC基因的GFP荧光表达,而对α-tubulin的GFP表达没有影响。同时发现,应用不同剂量的miR-106b(10nM和50nM),同时转染包含APC-3-UTR片段,检测发现荧光素酶活性与对照组相比的比值的均值介于0.237~0.593之间,各组增长倍数的98.75%置信区间均不包括1,而转染miR-106b抑制质粒(同时转染包含APC-3-UTR片段,检测发现荧光素酶活性与对照组相比的比值的均值介于1.950~3.317之间,各组增长倍数的98.75%置信区间均不包括1,说明miR-106b呈剂量依赖地方式抑制APC基因3-UTR片段的荧光表达,而抑制miR-106b表达,则可以促进荧光的表达。
构建APC-3-UTR片段突变的表达质粒(APC-3-UTR-dn),荧光素酶报告检测结果显示:miR-106b可以抑制荧光素酶的表达,而APC-3-UTR-mu,可以消除miR-106b所引起的荧光素酶表达抑制作用。
以上结果提示,APC是miR-106b的靶基因,miR-106b通过靶向APC的3-UTR区域,靶向抑制APC的表达。
8.APC在miR-106b所致的HCC细胞增殖中发挥重要作用。为了进一步检测APC在miR-106b所引起的HCC细胞增殖中的作用,我们首先利用siRNA沉默APC表达,再共转染miR-106b,检测其对HCC细胞增殖的影响,结果发现,抑制APC,可以显著增加BrdU阳性率(HepG2细胞中,F=41.148,P-=0.000;QGY-7703细胞中,F=24.561,P=0.000)。结果提示,抑制APC表达,促进细胞增殖。抑制miR-106b表达,并同时沉默APC基因表达,则BrdU阳性细胞比例显著上调(HepG2细胞,F=123.126,P=0.000;QGY-7703细胞,方差不齐,采用Welch校正后,F=12.613,P=0.000)。这些结果说明,抑制APC基因表达,则逆转了抑制miR-106b表达,抑制细胞增殖的作用。进一步证实,miR-106b是通过APC基因其作用。综上所述,我们的结果证实APC在miR-106b所诱导的HCC细胞增殖中发挥重要作用。
结论:
miR-106b过表达促进HCC细胞增殖,增强HCC细胞的克隆形成和不依赖锚定生长的能力,在肿瘤的转移中发挥重要作用;抑制miR-106b则可以逆转其促进细胞增殖的作用。
miR-106b促进HCC细胞增殖的作用机制是通过激活Wnt/β-catenin信号通路所实现。MiR-106b表达促进TOP/FOP荧光素酶的比例,并增加Wnt/β-catenin信号通路下游分子cyclinD1,p-pRb的表达,以及下游MYC,CYR61,CD44,Snail,TCF4,RUNX2基因的表达。并促进MYC,CYR61,CD44,Snail,TCF4,RUNX2基因的表达,并促进β-catenin向细胞核内转移。而抑制Wnt/β-catenin信号通路下游重要的效应分子TCF4,则可以逆转miR-106b所引起的细胞周期转化作用,逆转miR-106b促进细胞增殖的作用。
理论预测,Wnt/β-catenin信号通路中重要的分子,APC蛋白是miR-106b的重要靶分子。研究结果显示,miR-106b不仅可以抑制APC蛋白的表达,还呈剂量依赖的方式抑制包含APC-3-UTR片段的GFP荧光表达,而APC-3-UTR片段突变则可以逆转该作用。同时对细胞增殖和周期的影响检测发现,APC-3-UTR片段突变可以逆转miR-106b的促进细胞增殖,促进细胞周期G1/S期转变的作用。
因此,得出以下结论:miR-106b通过靶向抑制APC蛋白,激活Wnt/β-catenin信号通路,促进HCC细胞增殖。