转录组分析骨肉瘤复发分子特征并构建风险预测模型

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目的:骨肉瘤是最常见的原发性恶性骨肿瘤,主要影响年轻人的健康。不能切除或切除后复发的骨肉瘤患者的预后很差。本研究旨在寻找骨肉瘤的预后分子特征,并构建风险模型来预测预后。方法:从TARGET数据库中下载骨肉瘤患者的转录组数据和临床数据。分析在转移组和非转移组中差异表达的基因,并进行富集分析。进行单变量和多变量Cox回归分析以筛选预后基因并建立风险预测模型。然后开发并验证了一个结合临床信息的诺莫图,以预测患者在2、3、5年的总体存活率。结果:通过转录组分析共鉴定51个差异基因。其中38个上调基因,13个下调基因。GO富集分析显示差异基因主要参与了单核细胞增殖、细胞因子调控、IL-10调控和淋巴细胞增殖等途径。单变量Cox分析得到10个预后相关差异基因。并且构建了基于5个预后相关差异基因(AOC3、GPI、MYC、SLC27A5、RPL22L1)的多变量Cox回归模型,并成功地将患者分为高低危险组,结果显示出明显不同的预后。此外,在风险预测模型的基础上,将性别、年龄、风险评分、转移、肿瘤原发部位等临床信息纳入诺莫图,预测患者2、3、5年的总体生存率,模型C指数为0.77。结论:我们的研究提供了10个基因作为骨肉瘤预后的分子标志物,基于预后基因建立的风险模型能有效预测骨肉瘤患者的生存结局。
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