家蚕细胞中miRNA的检测、过表达及上调miRNA潜在靶基因的筛选

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MicroRNAs(miRNAs)是一类非编码的长约21-25nt的单链小RNA分子,线虫、果蝇、家蚕、人及拟南芥等生物中普遍存在。miRNA通过与靶基因mRNA特异性结合,诱导靶基因mRNA的降解或抑制蛋白的合成,从而参与调节细胞的增殖、分化、调亡、信号转染及肿瘤发生等多种生理学过程。目前,已有大部分的miRNA通过计算机和实验方法发现,其中家蚕有489条pre-miRNAs和567条成熟的miRNAs被鉴定,但对其功能还知之甚少。miRNA功能研究一般在细胞中上调或下调miRNA,通过gain-of-function或loss-of-function研究miRNA的靶基因和功能。目前为止,家蚕miRNA相关功能研究还很少。   本文采用转染miRNA真核表达载体或化学合成的miRNAmimics上调BmN细胞中miRNA的水平,从而研究miRNA的靶基因及其功能。首先通过miRNA基因芯片检测家蚕BmN细胞中内源表达的miRNAs,结果显示:只有73条家蚕miRNA被鉴定。因此,选择4条低表达或无表达的且在其它物种中起重要基因调控作用的miRNA在家蚕细胞中表达。首先将EGFP基因克隆至带有杆状病毒iel启动子、hr5增强子的昆虫系统真核表达载体pIEx-1上,形成可用于表达miRNA的重组表达载体pIEx-1-EGFP。然后将pri-mir-1a/8/14/133克隆至pIEx-1-EGFP载体中EGFP基因的下游,形成重组载体pIEx-1-EGFP-pri-mir-1a/8/14/133,转染至家蚕BmN细胞中表达成熟的miRNA;Stem-IoopRT-PCR结果显示,重组载体pIEx-1-EGFP-pri-mir-1a/8/14/133成功转染至家蚕BmN细胞,与对照组相比,转染pIEx-1-EGFP-pri-mir-1a/8/14/133重组质粒的家蚕BmN细胞中bmo-miR-1a,bmo-miR-8,bmo-miR-14,bmo-miR-133的相对表达量分别提高了32,4.4,6.6和3910倍:同时将化学合成的bmo-miR-1a/8/14mimics转染至家蚕BmN细胞,结果显示,bmo-miR-1a/8/14mimics成功转染至家蚕BmN细胞,与对照组相比,bmo-miR-1a,bmo-miR-8,bmo-miR-14的水平分别上调了56,39和2933倍;Northernblot进一步验证重组质粒pIEx-1-EGFP-pri-mir-133在家蚕细胞中能够有效的表达成熟的bmo-miR-133。由上可知,我们成功的在家蚕细胞中上调了bmo-miR-14/133基因。为了开展bmo-miR-14/133靶基因的筛选及其功能研究,表达谱芯片及双向电泳分析了miR-14/133基因上调对家蚕细胞基因mRNA及蛋白表达水平的影响,结果表明:bmo-miR-14改变了家蚕细胞中某些mRNA和蛋白的表达水平,mRNA水平差异基因有13条,其中表达下调的基因有6条;蛋白表达水平下调的基因有16条,主要为核糖体蛋白,翻译起始因子等。bmo-miR-133也使家蚕细胞中基因的mRNA及蛋白表达发生了改变,mRNA水平差异基因有9条,其中表达下调的基因有8条;bmo-miR-133使14-3-3蛋白的表达水平下调。进一步,miRNA靶位点分析表明,mRNA水平及蛋白表达水平下调的基因3UTR区都存在潜在的相应miRNA结合位点,是miRNA潜在的靶基因,后续研究拟开展这些结合位点的双荧光素酶体外验证实验。本课题为进一步开展bmo-miR-14/133在家蚕中的基因调控功能打下基础。
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