人参皂苷转化菌株的筛选及其产物分析

来源 :长春中医药大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:caory
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目的:筛选土壤中可以转化稀有人参皂苷的微生物,并研究其转化机制及特性。
  方法:以人参茎叶总皂苷为底物,富集培养微生物,经过分离得到单一微生物,再以人参皂苷Re、Rg1、Rb1为底物,对其进行转化,运用UHPLC-Q Exactive四级杆-静电场轨道阱高分辨液质联用技术对转化后的人参皂苷进行检测;通过单因素分析对28号菌转化人参皂苷Rb1进行工艺优化;利用ONT测序平台以及Nanopore测序平台对28号菌株进行全基因组测序鉴定其特征,并对该菌种进行GO、COG以及CAZy功能注释分析。
  结果:筛选得到30种具有转化能力的微生物,其中有4种对人参皂苷Rb1转化效果明显、2种对人参皂苷Rb1和Rg1均转化效果明显、1种对人参皂苷Rb1和Re均转化效果明显、4种对人参皂苷Rb1、Re和Rg1均转化效果明显。选用28号菌株转化人参皂苷Rb1并进行工艺优化,确定28号菌对人参皂苷Rb1转化的最适条件为转化时间24h、转化pH7.0、转化温度27℃,其转化率为48.40%。28号菌株全基因组测序结果表明该菌株基因组全长为4215536bp,GC含量为43.51%,预测编码了4229个开放阅读框(ORFs);GO分析的功能细分为43类,COG分析的功能细分为25类,CAZy分析该菌有108个与人参皂苷转化相关的基因。
  结论:参地土壤中富含大量的微生物,进一步明确了转化稀有人参皂苷微生物的筛选方法,为今后的相关研究奠定了基础。28号菌株的全基因组测序结果为今后进一步研究该菌种对人参皂苷的转化提供了依据。
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