液体高分辨核磁共振在蛋白质研究中的方法及其应用

来源 :中国科学院研究生院(武汉物理与数学研究所) | 被引量 : 1次 | 上传用户:iswhat
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本论文围绕液体高分辨核磁共振技术在蛋白质研究中的一些方法和应用展开研究工作。内容包括NMR实验技术的改进,NMR在蛋白质分子动力学以及蛋白质与配体相互作用研究中的应用。1.对近期液体高分辨核磁共振技术在蛋白质研究中的方法和应用方面的迅速发展(第一章),尤其是在蛋白质与配体之间的相互作用方面(第四章)进行了综述。简要概括了本论文所应用的蛋白质NMR谱学的基本原理(第二章)。2.研究了TCS-C7蛋白在溶液中的分子动力学性质。首先对TCS主链进行了顺序归属。其次发展了Clean SEA-HSQC脉冲序列,该技术可以选择性只检测与溶剂有交换的残基NH信号,而且不需氘代样品同样可以避免混合时间内由于纵向弛豫,及通过交换产生的来自于羟基,氨基质子的NOE杂信号的影响。将该技术应用于对TCS-C7的研究中,并与TCS-C7的溶剂接近度相对照,结果表明TCS-C7在溶液中的三维结构与已报道的晶体结构非常相似。进一步对其主链15N的弛豫和1H-15N的NOE数据进行分析,得到了残基水平的分子动力学信息。(第三章)3.随着蛋白质与配体结合研究的深入,开展了多个配体与单个蛋白相结合的研究。通过观测小分子配体的化学位移和纵向弛豫时间,对两个药物小分子配体(布洛芬与水杨酸)与人血清白蛋白(HSA)的竞争性结合进行了分析。由于竞争结合,当体系中一个配体浓度升高时会引起另一配体的游离态浓度增大,表现为化学位移向低场移动和弛豫速率降低。结果表明这两个配体在HSA分子上有一些共同的低亲和性结合位点。对于快交换体系,化学位移或弛豫速率的观测值是自由态与结合态配体的表观平均值,因而得以计算出结合态配体的浓度。(第五章)4.设计了横向弛豫加权的ROESY (CPMG-ROESY)实验,并用以表征两种配体与蛋白质的竞争结合及共结合。两种不同配体与蛋白质的共结合及竞争结合方
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