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随着社会经济的发展，人们开始更加关注自身的居住环境。人居环境是人类生产生活的基础，关系到人类的生存发展和社会的进步。加强对人居环境自然条件的动态研究，不仅能科学分析人居环境自然适宜性的空间格局和变化规律，协调区域内人口、资源和环境的可持续发展，而且能为区域的未来发展规划提供决策支持，对合理引导人口的空间分布和正确划分区域功能区具有重要的现实意义。
人居环境中的地形、气候、水文和土地覆被等自然要素不仅直接影响到人们的生活质量和身心健康，还会深刻影响人类居住环境的适宜性。本文基于三峡库区重庆段35个常规气象台站1997-2009年的气象数据、1∶5万重庆市DEM数据、三期（1997年、2005年、2009年）奉节县和巫山县1∶5万土地利用现状数据、三期（1997年、2005年、2009年）奉节县和巫山县TM影像以及人口、经济等相关资料，以25m×25m的栅格为基本评价单元，借助GIS、RS和SPSS等技术，结合两县的实际情况，选取包含地形、气候、水文和土地覆被在内的四个单项指标，计算得到两县地形起伏度、温湿指数、风效指数、着衣指数、水文指数和地被指数栅格数据集，然后基于各种指数与人口分布情况，采用相关系数法，确定各评价指标因子的权重，建立人居环境综合指数模型(HECI)，对奉节县和巫山县1997年、2005年和2009年人居环境自然适宜性进行定量动态评价分析，最后根据各乡镇人口数据（2009年）以及土地利用现状数据中的居民用地，对人口空间分布进行处理，再结合自然适宜性评价结果，分析两者的相互关系并提出优化建议。研究结果表明:
(1)1997年、2005年和2009年奉节县和巫山县适宜度最低的区域面积分别为151.73km2、264.95km2和162.85km2以及238.66km2、321.63km2和351.41km2，分别占总面积的3.71％、6.48％和3.98％以及8.07％、10.87％和11.88％，主要分布在奉节县的西南部及南部的七曜山、巫山系中海拔在1800m以上的区域和巫山县的东北部、西南部及东南部的大巴山、七曜山和巫山山脉中海拔在2000m以上的区域。这些区域的地形起伏度大，气候舒适度低，地被指数低，不适宜居住。2009年奉节县和巫山县生活在该区域内的人口数分别为1.45万人和0.89万人，仅占两县人口总数的1.36％和1.39％。
(2)奉节县和巫山县临界适宜区的面积分别为758.31km2、805.27km2和568.87km2以及423.12km2、657.49km2和563.05km2，分别占总面积的18.55％、19.70％和13.92％以及14.30％、22.23％和19.03％，主要分布在奉节县和巫山县的东北部、西南部、东南部海拔较高，地形较陡峭的区域，零星分布在其西北部和中部区域，该区域地形起伏度较大，气候舒适期较短，水文指数和地被指数较低;生活在该区域的奉节县和巫山县的人口数分别为8.04万人和6.14万人，占其人口总数的7.56％和9.78％。
(3)奉节县和巫山县低度适宜区的面积分别为1725.60km2、1333.23km2和1059.84km2以及802.45km2、906.16km2和804.81km2，分别占总面积的42.22％、32.62％和25.93％以及27.13％、30.63％和27.21％，主要分布在两县的河谷、地势较高的中低山和丘陵地区，分布较分散，区域内各地状况不同，中低山地区地形起伏度大，但气候舒适度、水文指数和地被指数较好，河谷和丘陵地区地形起伏度不大，气候舒适度较好，但水文指数和地被指数较低;两县分别有20.82万人和14.65万人居住在该区域，占全县人口的19.59％和22.98％。
(4)奉节县和巫山县中高度适宜区的面积分别为1451.36km2、1683.56km2和2295.44km2以及1493.77km2、1072.72km2和1238.73km2，分别占总面积的35.51％、41.19％和56.16％以及50.50％、36.27％和41.88％，主要分布在长江、大宁河、梅溪河、福田河、大溪河、洋溪河、马渡河、石笋河、草堂河、朱衣河等河流附近及零星分布在平行岭谷的槽坝地带和部分过渡地带，这些地方的地形起伏度低，气候舒适期长，地被指数较高，水文条件较好，特别是河流附近河网密度高，山地人居自然环境适宜性最好。该区域内奉节县和巫山县各有75.96万人和41.99万人居住，人口比例高达71.49％和65.85％。
总体上，奉节县和巫山县均较适宜人类居住，奉节县的人居环境自然适宜性优于巫山县。奉节县1997年、2005年和2009年人居环境自然适宜性呈上升趋势，而巫山县则呈先下降后上升趋势，两县生态环境均有所改善，越来越适合人类居住;但受两县独特的山地地貌和三峡库区的影响，其人居环境的空间分布差异较大。同时两县人口分布较为合理，大多生活在居住环境较为舒适的中高度适宜区。