肺微乳头状腺癌的基因图谱和免疫学特征分析

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微乳头型腺癌(Micropapillary adenocarcinoma,MPC)是肺腺癌(Lung adenocarcinoma,LADC)中最具侵略性的组织学亚型之一。尽管以微乳头成分为主的LADC的发生率较低,但近一半的浸润性肺腺癌包含微乳头成分,且会导致不良的预后。对具有不同微乳头含量的肺腺癌进行全面的遗传学和免疫学特征分析,能更好地发掘肺腺癌亚型的癌症生物学特性,并为后续治疗提供指导。本研究通过纳入43名已知病理类型的LADC患者的样本作为发现队列,根据微乳头成分的分布进行显微切割,按微乳头成分含量将组织分为高表达、低表达及匹配的无表达瘤块。通过将上述组别与113名未知病理类型的参考队列共同进行靶向下一代测序,分析微乳头成分的特征性基因改变,以及突变负荷和染色体变异。通过联合166名验证队列基因组测序结果,分析特征性突变基因的变化。通过绘制基因系统发生树探索MPC病变的遗传学特征。同时对发现队列中不同微乳头表达量的瘤组织进行CD4~+,CD8~+和PD-L1~+指标的免疫组化检测,分析其内免疫细胞群体比例的变化。研究结果发现微乳头腺癌病变的基因组突变和染色体不稳定发生率增加。队列交叉验证得出在微乳头腺癌中富集有转录终止因子1(Transcription termination factor 1,TTF1),脑特异性血管生成抑制因子3(Brain-specific angiogenesis inhibitor 3,BAI3),哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(Mammalian target of rapamycin,MTOR),细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2A(Cyclin-dependent kinase inhibitor2A,CDKN2A)和CDKN2B的遗传学改变。通过对肺腺癌绘制基因系统发生树及特征基因分析发现,不同浸润性肺腺癌具有相同的驱动子突变,但较其他亚型而言,在微乳头状亚型中存在更多的遗传学改变,且有部分特异性的遗传学变异事件。免疫组化结果显示微乳头病变占比越多的肿瘤,T细胞浸润越多,且PD-L1相关免疫抑制越强。通过基因组学和免疫特征研究,较全面地描绘了微乳头腺癌病变的遗传和免疫特征。通过对微乳头腺癌和/或含有微乳头状病变肺癌的免疫学检测,发现该亚型可能可获益于新型免疫治疗策略。
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