滇池位于中国西南部的云贵高原，是富营养化极其严重的湖泊之一。大清河是滇池入湖污染负荷最高的河流，因此削减大清河污染物刻不容缓。本研究以附加回流的生物接触氧化工艺(IBCOP)与分段进水的生物接触氧化工艺(SBCOP)与对大清河河道污水开展了现场河道旁路处理的比较试验研究，完成了2006年冬季枯水期、春季枯水期及夏季丰水期的工艺试验，在实验室对净化机理开展了相关的微生物学研究。 IBCOP对水质变化具有较好的适应性，调整各时期的运行参数，可以使COD的去除率稳定在50％左右；TP的去除率从冬季的20％逐渐上升至春季的50％以上，但夏季雨季时期随水质及气候因素波动较大；TN的去除受水温及溶解氧等因素的影响很大，去除率在冬季为5％，春季上升为18％以上，夏季进一步上升至30％以上。接种活性污泥可以加快系统的启动，反应器内生长的藻类及浮萍等水生植物对各污染物的去除也有一定辅助作用。 SBCOP对于COD、TN、TP有更好的去除率和适应性，是处理滇池入湖河道污水的理想工艺。硝化和反硝化率受温度的影响很大，在每个季节，硝化率SBCOP工艺明显高于IBCOP。对于TN的去除，SBCOP比IBCOP在冬季和春季期间有更好的去除率，但夏季由于SBCOP的高溶解氧抑制了反硝化的进行使得结果相反。此外，藻菌共生体系有利于污染物的去除。 从试验装置中筛选分离了2株利用NH4+-N和7株利用NO2--N作为营养源的异养菌株，由于滇池流域所有入湖河流都有很高的NH4+-N含量，利用NH4+-N的菌株可以用于河道污水的净化。在GenBank比对了6株细菌的16SrDNA基因序列，其中利用NH4+-N为营养源的菌株为根瘤菌属(Rhizobiumsp)进行的氮转化实验结果表明：该菌株28h内去除溶液中80％的NH4+-N，被去除的NH4+-N主要用于细菌的增殖，即反应体系中自养硝化作用不明显，而异养同化反硝化作用较强。在实验室建立了变性梯度凝胶电泳(DGGE)方法，为有效分析试验装置内的微生物群落结构提供了方法条件与参数。