目的:定量和定位分析慢性胃炎患者胃粘膜菌群,探讨菌群与粘膜炎症及幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)感染的相关性。方法:收集58例慢性胃炎患者的胃窦粘膜标本,提取胃粘膜基因组DNA,应用荧光定量PCR方法定量分析胃粘膜总细菌及Hp,进行相关性分析;12例慢性胃炎患者胃窦粘膜标本,石蜡包埋,切片,应用荧光原位杂交方法定位胃粘膜菌群;慢性胃炎和肠化生程度的分类依据新悉尼分类系统确定。结果:多元线性回归分析显示胃粘膜总细菌数与性别、年龄、肠化生程度无关,与Hp感染、慢性胃炎程度有关(P<0.05)。荧光定量PCR定量分析发现所有患者Log(胃黏膜总细菌数/g组织)平均值为10.00±0.62。Hp阳性组为10.30±0.91,明显高于阴性组9.64±0.78(P=0.005),并且Hp阳性组胃粘膜总细菌数与Hp细菌数目呈明显正相关(r=0.536,P<0.01),提示Hp感染可能影响胃粘膜总细菌定量。不同胃炎程度之间胃粘膜总细菌数有差异(P<0.05),其中重度胃炎组胃粘膜总细菌数明显高于轻、中度胃炎组(P<0.05,P<0.01),提示胃粘膜总细菌影响炎症程度。不同肠化生程度之间胃粘膜总细菌数无差异(P>0.05)。荧光原位杂交分析提示慢性胃炎患者胃粘膜细菌主要分布于胃粘膜表面、胃小凹及腺体中,细菌单个散在分布或聚集成团。结论:胃粘膜菌群与慢性胃炎程度、Hp感染有关,提示胃粘膜菌群数量增加可能参与粘膜炎症的发展。Hp感染可能影响胃粘膜菌群定量。慢性胃炎患者胃粘膜菌群主要分布于胃粘膜表面、胃小凹及腺体中,细菌单个散在分布或聚集成团。