本论文主要涉及两部分工作:一是几种糖类化合物，半乳糖凝集素Galectin-3抑制剂和α-糖苷酶抑制剂的设计合成;二是天然产物Bacillamide A/B的合成及对Bacillamide B的结构修正工作。全文共分为四章:　　第一章简要综述了计算机辅助药物设计的基本概况，包括计算机辅助药物设计的方法及其在药物发现与开发中的作用。同时重点介绍了具有的代表性的两个计算机辅助药物设计成功的例子:抗艾滋病毒药物以及抗流感病毒药物的设计与合成。　　第二章设计合成了一系列乳糖衍生物作为Galectin-3抑制剂，并利用表面等离子共振技术(SPR)分别测试了其与Galectin-3蛋白的结合活性，发现了活性较好的Galectin-3抑制剂，可以作为抗肿瘤药物的先导化合物。　　第三章利用一锅法形成噻唑啉的方法学从廉价易得的L-胱氨酸出发，分别以27％和30％的总产率完成了天然产物Bacillamide A/B的全合成。重新确证了Bacillamide B的构型是S构型并对其旋光值进行了修正。　　第四章α-糖菅酶抑制剂Z76分子是计算机辅助设计的一个氨基二糖类分子，通过分子对接及动力学模拟预测其与α-糖苷酶具有较好的结合活性，是潜在的治疗糖尿病药物。从廉价的葡萄糖和半乳糖出发，完成了Z76分子的两个模块的合成，并完成了两个模块的偶联。