毛竹VQ蛋白家族的基因鉴定及PeVQ28的功能分析

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毛竹(Phyllostachys edulis)的应用范围广,在我国林业生产中具有十分重要的地位,而自然环境中的不利条件会给毛竹林带来不同程度的损害。随着拟南芥、水稻、葡萄、玉米等物种对VQ蛋白家族的研究表明该基因家族参与植物的生长发育过程并响应生物及非生物胁迫的应答调控。目前,关于毛竹VQ蛋白家族的研究论文还未见发表。本研究我们首先从生物信息学入手,通过基因结构、保守基序、序列比对、系统进化树以及上游启动子等方面对毛竹VQ蛋白家族进行系统的了解分析,并且利用转录组数据对该基因家族在各个组织中的表达情况进行分析,然后分析了该基因家族在PEG、SA、ABA胁迫条件下的相对表达情况。最后,分离克隆出逆境相关基因Pe VQ28,并对其进行亚细胞定位实验、相互作用进行验证以及抗逆性的初步分析。本研究获得的主要成果如下:1)从毛竹基因组中鉴定出29个VQ家族基因,并和拟南芥和水稻的VQ家族基因进行比对,将这些基因命名为(Pe VQ1~Pe VQ29),划分为7个亚家族。2)Pe VQ28为位于PH01007611号支架上的一个基因,基因全长为1659 bp,编码区域为513 bp,编码一个长度为170 aa的蛋白,该蛋白等电点为5.75,相对分子质量为18873.68 Da。3)亚细胞定位实验表明Pe VQ28蛋白在烟草的细胞核中表达。4)酵母双杂交实验和Bi FC实验表明VQ基因可以和WRKY转录因子相互作用且相互作用形成的复合物位于细胞核中。5)在含有300 m M甘露醇和0.5μM ABA的MS平板上的野生型和转基因株系萌发均受到抑制,而转基因株系的萌发率的明显低于野生型拟南芥,根长统计结果显示在含有300 m M甘露醇的MS平板上的转基因株系的根长低于野生型拟南芥。
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