农村商业银行作为农村信用社改制而来的新生体系，在经营上既秉承了农村信用社支农的作用又体现出现代商业银行具有的营业特点，成为全新的，适合农村需要的商业金融机构，为农村发展和金融需求注入新的活力。随着农村商业银行作为“金融企业”的目标确定，如何加强经营管理，提高盈利能力，提升服务水平便成为农村商业银行发展中的重要问题。因此，根据我国的实际情况，需要制定一套适用于我国农村商业银行分支机构效率的绩效评价方法和程序来提高自身竞争力。　　对商业银行分支机构绩效分析主要需要解决两个问题:第一问题为各个分支机构内部的效率评估以及改进策略的提出，第二个问题为各分支机构之间的绩效评价。针对以上问题，本文从研究背景和现实意义出发，首先对商业银行绩效问题的研究进行评述，并介绍了国内外关于这一领域的研究情况。以W农村商业银行21家分支机构作为研究样本，选取2013年5～8月四个月的数据，利用非参数绩效评价方法——数据包络分析法(DEA)分析了W商业银行分支机构的综合技术效率、纯技术效率和规模效率。针对传统DEA模型不允许异常离群数据的存在以及不同决策单元的效率缺乏可比性问题，运用基于层次模型的DEA改进方法对我国农村商业银行分支机构的改进策略进行了测算，证明了基于层次模型的DEA方法在提出改进策略上的可行性和优越性。针对传统DEA模型和基于层次的改进DEA模型所忽略的风险变量对效率测算的影响，为充分识别影响商业银行风险水平的相关因素，构建了资本监管环境系商业银行资本与风险的联立方程模型，运用3SLS方法进行了实证分析，识别了资本与风险变动以及影响因素的内在机理，并且提出将风险相关的指标（分支机构规模、不良贷款率、存贷比以及流动性指标）纳入农村商业银行的绩效评价指标体系，构建一个基于风险的绩效评价指标体系以期实现农村商业银行各分支机构的全面协调可持续发展。