mTOR基因多态性与肝细胞癌遗传易感性的关联研究

来源 :广西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:redghy
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目的哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian Target of Rapamycin, mTOR)在细胞生长、增殖、分化等过程起中心调控作用。mTOR信号通路是细胞内重要信号通路之一,mTOR信号通路异常在肿瘤发生发展过程中起重要作用。mTOR通路过度活化可以促进肿瘤细胞生长、增殖,抑制细胞凋亡、自噬,促进细胞运动、侵袭、转移和血管生成。mTOR基因的某些单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点可能影响mTOR的转录活性和表达水平进而影响蛋白质功能。因此,本研究采用病例对照研究方法,研究mTOR基因的2个潜在生物学功能SNP位点即rs2536(T>C)和rs1883965(G>A)及其与环境因素的交互作用、SNP位点之间的交互作用与肝癌遗传易感性的关系。本研究为揭示mTOR基因多态性与肝癌遗传易感性的关系提供实验依据。方法本研究的对象包括1048例肝癌新发病例和1052例非肿瘤对照。病例为2007年6月—2011年4月期间于广西医科大学第一附属医院和广西医科大学肿瘤医院住院治疗的肝癌新发病例,纳入病例组的患者均为广西壮族自治区居民(居住10年以上),并经临床表现、血清肝癌标志物以及肝组织病理学等检查确诊的,既往无其他器官恶性肿瘤史及肝脏转移的,调查前尚未接受放疗和/或化疗。对照组选自广西医科大学第一附属医院(脊柱骨病外科、眼科、创伤骨科手外科)同期住院治疗的相同地区的非肿瘤患者,并且在性别、民族、年龄等方面与病例组频数匹配。通过统一的调查问卷收集每个研究对象的一般人口学以及相关环境暴露因素资料。采集研究对象外周静脉血3ml置于含0.2mL酸性枸橼酸盐(Acid Citrate Dextrose, ACD)抗凝剂的真空抗凝管中,运用酚-氯仿法提取研究对象全血基因组DNA。所有研究对象均自愿参加,均签署知情同意书。本研究的开展得到了广西医科大学伦理委员会的批准。运用TaqMan MGB探针等位基因分型技术对mTOR基因rs2536(T>C)和rs1883965(G>A)位点进行基因分型。应用t检验和χ2检验方法分别分析计量和计数资料,运用非条件Logistic回归计算各变量的比值比(odds ratios, OR)和95%可信区间(confidence intervals, CI),并分析各SNP位点基因型、基因-环境因素的交互作用、SNP位点之间的交互作用与肝癌遗传易感性的关系。所有分析采用SPSS13.0软件,双侧检验,检验水准a=0.05。此外,连锁不平衡和单倍型分析采用SHEsis软件。结果(1)研究对象一般特征:病例组和对照组人群在年龄、性别、民族等方面差异无统计学意义(P>0.05)。吸烟、饮酒及HBV感染的分布在病例组明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.001)。(2)基因型在对照人群分布:rs2536(T>C)和rs1883965(G>A)位点基因型频率在对照组中的分布均符合哈迪-温伯格遗传平衡定律(Hardy-Weinberg Equilibrium, HWE)(P>0.05)。(3) mTOR基因多态性与肝癌遗传易感性关系:在病例组和对照组中rs2536(1>C)和rs1883965(G>A)位点基因型及等位基因频率分布差异均无统计学意义(P>0.05)。多因素Logistic回归分析显示,调整年龄、性别、民族、吸烟、饮酒和HBV感染等因素后,与rs2536(T>C)位点TT基因型相比,TC、CC基因型与肝癌发病风险之间无统计学关联(TCvs.TT:OR=1.03,95%CI:0.74-1.44; CC vs.TT:OR=0.46,95%CI:0.16-1.36);与rs1883965(G>A)位点GG基因型相比,亦未发现AG, AA基因型与肝癌发病风险有关(AGvs.GG:OR=1.10,95%CI:0.77-1.56; AAvs.GG:OR=0.35,95%CI:0.04-2.84)。(4)分层分析:分别按年龄、性别、民族、吸烟史、饮酒史和HBV感染等因素分层分析,未发现rs2536(T>C)和rs1883965(G>A)在各层间与肝癌的发病风险有统计学关联,亦未发现上述暴露因素与rs2536和rs1883965的交互作用与肝癌的发病风险有关联。(5)rs2536(1>C)和rs1883965(G>A)的交互作用:对rs2536(T>C)和rs1883965(G>A)位点作交互作用分析,未发现其交互作用与肝癌发病风险有关联。(6)单倍型分析:连锁不平衡(linkage disequilibrium, LD)分析结果显示,-2536(T>C)和rs1883965(G>A)位点之间不存在强连锁不平衡(r2=0.011)。进一步对两多态性位点进行单倍型分析。结果显示,本研究人群中,rs2536(T>C)和rs1883965(G>A)位点构成的常见单倍型是:Trs2536G1883965、Crs2536G rs1883965和Trs2536A1883965。与Trs2536Grs1883964相比,Crs2536Grs1883965和Trs2536A1rs883965与肝癌发病风险之间无统计学关联(Trs2536Grs1883965VS. Crs2536G rs1883965:OR=1.04,95%CI:0.85-1.27, P=0.110; Trs2536Grs1883965vs.Trs2536Ars1883965:OR=1.09,95%CI:0.87-1.36, P=0.591)。结论未发现mTOR基因rs2536(T>C)和rs1883965(G>A)SNP与肝癌遗传易感性有关联。我们的研究结果需要在不同人群中进一步验证。
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