RAS基因突变和PHLPP1在髓系白血病中的作用

来源 :苏州大学 | 被引量 : 6次 | 上传用户:anshuly
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第一部分:应用高分辨率熔解曲线分析检测RAS基因突变方法的建立目的:RAS基因突变是急性髓系白血病中最常见的基因突变之一,本研究拟利用LightScanner平台建立高分辨熔解曲线分析检测NRAS和KRAS基因各热变区突变的方法,评价该方法的灵敏度,特异性及可靠性。方法:分别设计扩增NRAS和KRAS基因各热变区的HRM引物和测序引物,应用HRM引物进行PCR扩增,行HRM分析,阳性标本进一步应用测序引物PCR扩增后测序验证,同时应用野生型克隆对突变型克隆进行不同程度稀释后进行检测,评价HRM方法的灵敏度。结果:NRAS和KRAS基因杂合子突变的熔解曲线和熔解峰与野生型明显不同,通过峰型的改变可以很容易识别杂合子突变。NRAS和KRAS基因纯合子突变的熔解曲线峰型与野生型相似,但熔解峰出现可辨识的漂移。HRM分析阳性标本均经DNA测序证实。结论:利用LightScanner平台成功建立了HRM筛查NRAS和KRAS基因突变的方法,该方法具有快速,高通量,灵敏度高的特点,可用于白血病患者的临床检测。第二部分:急性髓系白血病RAS基因突变分析目的:应用高分辨熔解曲线分析(HRM)及DNA直接测序法检测504例中国AML患者的NRAS和KRAS基因所有热变区的突变状态,分析其在中国AML患者的突变率,突变谱,以及与AML临床特征的关系。方法:收集504例急性髓系白血病患者的初诊骨髓液,分离骨髓单个核细胞并提取基因组DNA,设计扩增NRAS和KRAS基因热变区:密码子12,13,和61的HRM引物,分别进行PCR扩增,将PCR产物进行HRM分析筛选突变标本。将阳性标本进一步PCR扩增行DNA测序验证。了解RAS基因突变在中国AML患者中的突变率和突变谱,比较RAS基因突变阳性和阴性患者之间骨髓细胞形态学,遗传学及临床资料的差异,分析RAS基因突变在AML患者中的预后意义。结果:1.在504例中国成人AML患者中,61(12%)名患者伴有RAS基因杂合突变,无纯合突变。其中NRAS和KRAS突变率分别为9.7%(49/504)和2.9%(15/504)。2.DNA测序显示,c.35G>A (rs121913237: G>A; p.Gly12Asp和rs121913529:G>A; p.Gly12Asp)和c.38G>A (rs121434596: G>A; p.Gly13Asp和rs112445441:G>A; p.Gly13Asp)是最常见的碱基置换类型,导致甘氨酸被替换成天冬酰胺。3.伴RAS基因突变的AML患者外周血白细胞计数明显高于无RAS基因突变的患者,在去除预后良好核型组后进行比较,两组差异仍具有显著性(P<0.05)。在中位年龄,性别比例,中位外周血血红蛋白浓度及血小板计数上,两组之间无显著性差异。4.RAS基因在FAB亚型M4和M5中的突变率(分别为21.6%和20.6%)明显高于其他亚型(7.5%,P=0.006和0.005)。相反的,RAS基因突变少见于M3型(2.5%,P=0.004)。5.RAS基因突变在不同预后核型组间的分布具有显著性差异(P=0.02)。在伴有11q23异常或inv(16)的患者中,RAS基因突变率明显高于总体的RAS基因突变率(分别是50%和66.6%,P=0.002和0.04)。6.FLT3-ITD在伴有RAS基因突变患者中的发生率明显低于在无RAS基因突变的患者中的发生率(5%和15%,P=0.03)。NPM1基因突变与RAS基因突变无相关性。7.无论是在总体AML患者中,还是在各种不同的预后分组及单核细胞白血病组中,RAS基因突变不影响患者的总生存。在正常核型组进行多因素分析显示,仅年龄和FLT3-ITD为独立预后因素。结论:RAS基因在中国AML患者中的突变率和突变谱与西方人群相似,RAS基因突变与特定生物学特征的AML亚群相关,但是对患者总生存无影响。第三部分:PHLPP1在慢性髓细胞白血病中的作用目的:研究PHLPP1对慢性髓细胞白血病(CML)细胞株K562细胞增殖,细胞周期及细胞凋亡等细胞生物学的影响及PHLPP1在CML原代细胞中的表达。方法:QRT-PCR和Western-blotting检测急性髓系白血病细胞株THP1,HL-60和慢性髓细胞白血病细胞株K562,Meg01以及原代细胞中PHLPP1的表达;应用Lipofectamine2000将真核过表达载体PCDNA3.0-PHLPP1转染K562细胞,建立过表达PHLPP1的稳定转染细胞株K562-PHLPP1;台盼蓝拒染法绘制细胞生长曲线;流式细胞仪检测细胞周期,细胞凋亡;定量PCR检测慢性髓细胞白血病原代细胞中miR190的表达。结果:1.QRT-PCR及Western-blotting显示慢性髓细胞白血病细胞株K562,Meg01较急性髓系白血病细胞株THP1,HL-60中PHLPP1表达水平明显下调(P<0.01)。2.QRT-PCR及Western-blotting鉴定过表达PHLPP1稳定转染细胞株显示,K562-PHLPP1细胞株内PHLPP1水平较转染对照细胞株K562-control显著升高(P<0.01),表明建株成功。3.过表达PHLPP1的K562细胞增殖速度较K562转染对照细胞减慢,培养48小时后两者细胞计数具有显著性差异(p<0.05)。4.过表达PHLPP1的K562细胞细胞周期G1/S比例(0.695±0.026)明显高于K562转染对照细胞(0.416±0.019)(P<0.05)。在血清饥饿状态下结果相似。5.仅仅过表达PHLPP1不足以诱发K562细胞凋亡,但能明显增强伊马替尼诱导的K562细胞凋亡。应用1.0μM伊马替尼作用于K562-PHLPP1及K562-control细胞,分别在作用0h,24h,48h,72h检测细胞凋亡率,发现两组细胞早期凋亡率均随作用时间延长而增高,在伊马替尼作用48小时后,K562-PHLPP1细胞早期凋亡率明显高于K562-control细胞(P<0.05)。6.经2.0μM伊马替尼作用于K562细胞0h,12h,24h,36h,细胞内PHLPP1蛋白水平在12h即明显升高(P<0.05),36h达到最高(P<0.01)。7.QRT-PCR显示,CML原代细胞内PHLPP1平均水平与K562细胞株一致(P>0.05),较急性髓系白血病细胞株THP1明显减低(P<0.01)。Western-blotting结果与QRT-PCR结果相符。8.CML原代细胞内miR190表达水平与PHLPP1表达水平无相关性(r=-0.07,P=0.78)。结论:1.PHLPP1在CML细胞株K562中低表达,过表达PHLPP1可通过阻滞K562细胞周期于G1期抑制细胞增殖;2.仅仅过表达PHLPP1不足以诱发K562细胞凋亡,但明显增强伊马替尼诱导的K562细胞凋亡,伊马替尼能上调K562细胞内源性PHLPP1的表达。3.CML原代细胞内PHLPP1表达水平减低,与miR190表达无相关性。
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