经济的发展伴随着制度的变化,随着全国中小企业股份转让系统接受挂牌以来,一批在股转系统制度中挂牌交易的中小企业逐步增多,创造了我国多层次资本体制的必要组成板块,同时也是推动我国经济发展的重要力量。因此,对于新三板行业来说我们对其的监督绝不能忽视,对于为新三板企业提供审计服务的会计师事务所和审计人员而言,这也是一项具有挑战性的任务。通常来说,新三板企业通常具有的特点是信息披露不全面、内控制度不健全等自身特性,这都会导致新三板企业的审计风险升高。另外,审计人员在新三板领域的经验短缺、未能勤勉尽责,以及会计师事务所质量控制较差等因素也使得检查风险增加。本文在经过对比新三板企业与上市公司的不同之后,总结了新三板企业审计的特征,基于全国中小企业股份转让系统的自律监管措施决定书对新三板企业的审计风险进行统计和归纳,并结合对会计师事务所审计人员的问卷调查结果来进行佐证,之后分别从审计环境、会计师事务所以及被审计单位这三方面切入进行审计风险成因的分析。之后,选取R会计师事务所审计新三板A公司失败事件进行案例分析,在分析了审计A公司的重大错报风险和检查风险之后,分别从审计环境、会计师事务所和被审计单位三方面探究其风险成因。在综合分析新三板企业审计风险及成因的基础上,结合了2020年1月13日证监会新发布的《非上市公众公司信息披露内容与格式准则第9号——创新层挂牌公司年度报告》和《非上市公众公司信息披露内容与格式准则第10号——基础层挂牌公司年度报告》,以及2020年3月1日起施行的新《中华人民共和国证券法》,提出新三板企业审计风险防范措施的建议,希望可以在一定程度上帮助控制新三板企业的审计风险,规范市场运作。