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本试验用PCR-SSCP和RFLP方法检测京海黄鸡Apn，MDH和IGF-Ⅰ基因的SNP。系统研究脂联素(Adiponectin，Apn)，苹果酸脱氢酶(Malate Dehydrogenase，MDH)和类胰岛素生长因子(Insulin-like growth factor-Ⅰ，IGF-Ⅰ)基因SNP，并与京海黄鸡的生长性状、繁殖性状、屠宰性状和肉品质性状进行联合分析，为京海黄鸡早期生长分子标记辅助选择提供有效的遗传标记。研究结果如下：
1.京海黄鸡Apn基因的部分5侧翼区和编码区进行了分子遗传学研究，发现的SNP有：C1251G，C1608T，G1773A，A1782G，T1902C，G1993C和G2013A。Apn基因的7个SNP中有5个处在编码区，但都是同义突变，这5个碱基的突变未能导致氨基酸的改变。MDH基因253位置检测到T→C的突变。IFG-Ⅰ基因在SSCP筛查时发现引物P11具有多态性，是由两个A的插入引起的。
2.京海黄鸡中检测到的AD2、AD7、MD和P11座位都属于中度多态(0.50＞PIC＞0.25)位点，AD5和AD6座位属于高度多态(PIC＞0.50)位点。
3.京海黄鸡Apn基因AD2座位AA基因型个体开产日龄显著小于AB基因型个体(P＜0.05)，AA基因型个体的300日龄产蛋数也显著高于AB基因型的个体(P＜0.05)；AD5座位h3h5基因型个体的开产日龄极显著低于h1h1基因型的个体(P＜0.01)，京海黄鸡h3h5基因型个体的300日龄产蛋数和66周龄产蛋数显著高于h1h1基因型的个体(P＜0.05)；AD6座位h2h5基因型个体的300日龄产蛋数和66周龄产蛋数显著(P＜0.05)或极显著(P＜0.01)高于h1h5基因型的个体；AD7座位GG基因型个体的开产日龄显著小于AA基因型的个体(P＜0.05)，GG基因型个体的300日龄产蛋数和66周龄产蛋数显著大于AA基因型个体(P＜0.05)。Apn基因不同座位对产蛋性状的主效应指数都很小，推测Apn基因可能与影响产蛋性状的主效基因连锁。
4.京海黄鸡Apn基因AD2、AD5和AD6基因座对京海黄鸡脂肪沉积有显著效应，且性别效应明显：公鸡群体中AD2座位BB基因型个体的腹脂重和腹脂率显著高于AA型个体的腹脂重和腹脂率(P＜0.05)，在母鸡群体中，BB基因型个体的腹脂率显著高于AA基因型个体(P＜0.05)；AD2座位BB基因型对腹脂率的贡献率达到30％。
在母鸡群体中，AD5座位h1h3基因型个体的腹脂重和腹脂率最大，极显著高于h2h3基因型个体均值(P＜0.01)，h1h3基因型对母鸡的腹脂重和腹脂率的贡献率分别为48.71％和12.72％。AD6座位h3h4基因型和h2h5基因型个体的腹脂重和腹脂率显著高于h2h3型个体(P＜0.05)。AD6座位h3h4基因型对母鸡的腹脂重和腹脂率的贡献率为40.98％和10.99％，h2h5型分别为18.68％和32.93％。
5.京海黄鸡MDH基因BB基因型个体的300日龄产蛋数和66周龄产蛋数极显著低于AA基因型和AB基因型个体(P＜0.01)。BB基因型个体的腹脂重和腹脂率均最低，与AA基因型个体差异显著(P＜0.05)。BB基因型是降低腹脂性状的优势基因，BB基因型对腹脂重和腹脂率的遗传贡献率在公鸡群体中为-24.18％和-30.18％，在母鸡群体中为-33.65％和-18.24％。MDH基因对京海黄鸡的腿肌重有明显效应。推测MDH基因可能是影响鸡脂肪性状和繁殖性状的主效基因或与控制脂肪性状和繁殖性状的主效基因相连锁。
6.IGF-Ⅰ基因引物P11检测的多态性对京海黄鸡脚重有极显著影响，DD基因型个体的脚重显著高于CC型个体。该基因座对京海黄鸡公母鸡的脚重MEI都大于11％。
7.京海黄鸡Apn基因、MDH基因和IGF-Ⅰ基因两两或三者对初生重的互作效应显著(P＜0.05)或极显著(P＜0.01)。京海黄鸡Apn基因和IGF-Ⅰ基因对开产日龄和300日龄产蛋数互作效应显著(P＜0.05)。