氨气（NH3）是一种无色、水溶性、刺激性的碱性气体,由含氮物质还原和有机物的细菌分解产生。NH3是鸡舍中的主要环境污染物之一,对人体和鸡的健康构成威胁。此外,NH3在大气污染重发挥重要的作用,是大气气溶胶的组成成分,对人类和其他生物带来负面影响。鸟类对NH3高度敏感。空气中的NH3能抑制肉鸡的免疫力,甚至增加肉鸡的死亡率。鸡淋巴器官（法氏囊和胸腺）在免疫中具有重要作用。然而,NH3对鸡淋巴器官（法氏囊和胸腺）的害作用的生物学机理仍然不清楚,因此,本研究旨在从多角度（炎症、凋亡和自噬）探讨NH3对鸡淋巴器官（法氏囊和胸腺）的毒性作用的机理。将135只实验（Ross 308）鸡随机分为三组,每组NH3浓度分别为:低NH3组（对照组）为5.0 mg/m3 NH3,中NH3组为 10.0-15.0 mg/m3 NH3,高 NH3组为 20.0-45.0 mg/m3 NH3。在实验的第 14 天、第 28 天和第42天,将鸡安乐死（每次每组45只）,采集法氏囊和胸腺样品。为了研究NH3对鸡法氏囊和胸腺组织的毒性影响,我们进行了苏木精和伊红染色,透射电镜,末端脱氧核苷酸转移酶介导的dUTP缺口末端标记（TUNEL）,免疫荧光（IF）,酶联免疫吸附试验（ELISA）,微孔板分光光度法,qRT-PCR,蛋白免疫印迹检测。开展了如下研究内容:炎症、细胞凋亡以及自噬的形态学变化,NO含量、iNOS活性、炎性相关因子含量(包括白细胞介素6（IL-6）和IL-1β、以及肿瘤坏死因子α（TNF-α）、炎症相关因子（包括核因子kappa B（NF-κB）、环氧合酶-2（Cox-2）、toll样受体2A（TLR-2A）、iNOS,IL-6、IL-10、IL-18和IL-1β）的mRNA表达、氧化应激相关指标（包括过氧化氢酶（CAT）、谷胱甘肽（GSH）、谷胱甘肽过氧化物酶（GSH-Px）、过氧化氢（H2O2）、丙二醛（MDA）、超氧化物歧化酶（SOD）、胃液γ-谷氨酰转移酶（GGT）和总抗氧化能力（T-AOC））的含量和活力、细胞凋亡相关因子（包括p53、细胞色素C（Cyt-C）、B淋巴细胞瘤-2（Bcl-2）、Bcl-2 X蛋白（Bax）、Bcl-2 同源拮抗剂杀伤蛋白（Bak）、caspase-3、caspase-9、cleaved casapase-3 以及cleaved caspase-9）的mRNA和蛋白表达、线粒体相关因子（包括动态蛋白相关蛋白1（Drp-1）、有丝分裂融合1/2（Mfn1/2）、线粒体裂变因子（Mff）、光萎缩1（Opal））的mRNA和蛋白表达、三磷酸腺苷（ATPase）相关因子（包括Na+/K+ ATPase、Ca2‘ATPase、Mg2+ATPase以及Ca/Mg2+ATPase）的活力、自噬相关因子（microRNA-99a-3p、雷帕霉素靶标（mTOR）、微管相关蛋白轻链轻链3-I（LC3-I）、LC3-Ⅱ、磷酸盐和张力蛋白同源物（PTEN）、蛋白激酶B（AKT）、自噬相关-5（ATG-5）、Becline-1和动力蛋白（Dynein））的mRNA和蛋白表达、能量相关因子（乌头酸酶2（ACO-2）、己糖激酶1（HK-1）,己糖激酶2（HK-2）,乳酸脱氢酶A（LDHA）,乳酸脱氢酶B（LDHB）,丙酮酸激酶（PK）,磷酸果糖激酶（PFK）和琥珀酸脱氢酶复合物-B（SDB）的活力）的mRNA和蛋白表达、血清生化参数(碱性磷酸酶（AKP）,天冬氨酸转氨酶（AST）,丙氨酸转氨酶（ALT）和γ-谷氨酰转移酶（GGT）活力。结果表明:（1）NH3损伤了法氏囊和胸腺组织,包括导致炎症、凋亡和自噬。（2）NH3 暴露提高了 H2O2、GGT 和 MDA 抗氧化酶,降低了 CAT、GSH、GSH-Px、SOD和T-AOC,引起了鸡淋巴器官氧化应激。（3）在NH3暴露下,NO含量和iNOS活性以及炎症相关因子(NF-κB、TLR-2A、Cox-2、iNOS、IL-6、IL-1β、TNF-α、IL-18 和 IL-10 的 mRNA表达升高了,炎症反应发生了。（4）NH3暴露降低Bcl-2、mnf1、mnf2和opA1的mRNA和蛋白表达,提高了 Bax、Bak、caspase-3、caspase-9、p-53、Cyt-C、Drp-1 和 mff 的 mRNA 表达,降低了 caspase-3和caspase-9蛋白的表达水NH3暴露平,引起了鸡淋巴器官细胞凋亡。。（5）NH3 暴露抑制了自噬相关基因 mTOR、LC3-I、LC3-II、PTEN、AKT、atpg-5、Becline-1和Dynein的mRNA和蛋白质表达,增加了 microRNA-99a-3表达,损伤了CD8+B 和 T 淋巴细胞,降低了 ATP 酶（Na+/K+ATPase,Ca2+ATPase,Mg2+ATPase）活力,并抑制能量代谢相关基因（ACO-2、HK-1、HK-2、LDHA、LDHB、PK、PFK和SDHB）的mRNA和蛋白质表达。导致了鸡淋巴器官自噬。microRNA-99a-3通过负调控靶基因PTEN参与了 NH3引起鸡法氏囊自噬。（6）NH3暴露增加了血清生化指标ALT,AKP,AST活性,意味着鸡受到NH3的负面影响。总之,我们的发现表明,NH3暴露会影响肉鸡淋巴器官的结构完整性和正常功能,线粒体功能障碍和氧化应激,干扰能量代谢和ATPase活性的过程,并通过炎症,凋亡减少CB8+B和T淋巴细胞并且,自噬。综上所述,我们的发现为评估接触NH3对肉鸡的有害影响以及人类病理生理学提供了线索。