Shewanella oneidensis中双组分系统调控β-内酰胺酶表达机制的研究

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β-内酰胺类抗生素可以竞争性地与青霉素结合蛋白结合,从而干扰细胞壁肽聚糖的合成,使细菌裂解死亡。伴随着抗生素的广泛使用,细菌产生的耐药性问题日趋严重。革兰氏阴性菌对β-内酰胺类抗生素最普遍的耐药机制是产生β-内酰胺酶水解抗生素。Shewanella oneidensis MR-1因D型β-内酰胺酶Bla A(bla A编码)的产生对β-内酰胺类(如氨苄青霉素等)具有天然抗性。前期研究发现,该菌中bla A基因的表达受氨苄青霉素诱导,同时青霉素结合蛋白PBP1a(mrc A编码)缺失后bla A呈组成型高表达。bla A基因的诱导表达模式明显不同于已有的研究,但其具体调控机制仍不清楚。本研究通过转录组测序寻找bla A诱导表达过程中的关键调控蛋白,并深入探究其调控机制。首先,本研究对bla A基因诱导型表达(WT_100)和组成型高表达(mrc A)时的转录本进行测序,发现了34个共同上调和8个共同下调的基因。在共同上调的基因中,包括编码β-内酰胺酶的bla A、编码(p)pp Gpp合成酶的rel V、编码分选酶系统的SO2194-96操纵子以及编码双组分系统的SO2192/SO2193和pho P/pho Q等。此外,转录组测序结果还表明,由氨苄青霉素和PBP1a引起的肽聚糖循环失调,影响了铁稳态、物质转运、细胞呼吸和电子传递链等多个代谢途径。通过基因敲除和回补,发现SO2192和SO2193的缺失使菌株失去对氨苄青霉素的抗性。进一步的研究发现,这些突变株中bla A基因的表达不再受氨苄青霉素诱导,Bla A酶活也不再增强。因此,SO2192/SO2193在bla A基因诱导表达过程中发挥至关重要的作用,将其分别命名为sbr K和sbr R。其中,sbr K编码组氨酸激酶,sbr R编码反应调节蛋白,两者共同组成双组分系统。生物信息学分析表明Sbr K的第508位组氨酸(Sbr KH508)和Sbr R的第52位天冬氨酸(Sbr RD52)是保守的磷酸化位点。这些磷酸化位点突变后,氨苄青霉素不能诱导bla A基因的表达,也不能增强Bla A的酶活。细菌基因RACE扩增和bla A启动子截短实验结果表明,bla A基因的转录起始位点位于起始密码子上游38 bp处,Sbr R与bla A的结合位点可能位于起始密码子上游97 bp和150 bp之间。Lac Z报告系统和氨苄青霉素敏感性实验表明,Sbr KR可以进行自调控,组分间的信号传递高度特异,不受其他双组分系统的串扰。Sbr R除调控bla A和sbr KR外,还能调控pds O、cre D、rel V、pho P、SO3810和SO2725基因的表达。综上,本研究发现S.oneidensis中双组分系统Sbr KR调控bla A的诱导表达。当氨苄青霉素存在时,组氨酸激酶Sbr K感知信号,通过保守位点Sbr KH508和Sbr RD52的磷酸化,完成与反应调节蛋白Sbr R间的信号传递,从而调控靶基因bla A的表达,增强细菌对氨苄青霉素的抗性。
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