水稻少分蘖基因LRT1的遗传分析及精细定位

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水稻是我国的主要粮食作物,其产量相关性状一直是分子与育种学家的研究热点。分蘖与株高是保证水稻高产稳产的两个关键因素,其中分蘖数对应着有效穗数,直接影响着水稻产量,而株高则影响植株的生物量和抗倒伏能力,间接影响水稻产量。本研究的少分蘖突变体(lrt1)材料来源于粳稻品种日本晴与籼稻材料观33的重组自交系后代。与野生型相比,lrt1表现出多效性缺陷,包括植株矮化、叶片变窄、分蘖数目减少、生育期延长及穗粒数减少等表型。通过与ZH11构建的F1及F2分离群体,遗传学分析表明lrt1受一对单隐性核基因控制。采用图位克隆策略,利用541个突变表型个体,最终将该基因定位在第2号染色体长臂M6和M7两个标记之间约99kb区间内,该范围共包含5个开放阅读框,分别为LOC_Os02g4147为 LOC_Os02g41480、LOC_Os02g41490、LOC_Os02g41500和LOC_Os02g41510。为确定候选基因,我们开展了 qRT-PCR分析检测,发现LOC_Os02g41480和LOC_Os02g41500这两个基因的表达水平明显的下调,均编码一个与细胞壁关联的蛋白激酶家族蛋白,因此推测两者之一很可能为LRT1的候选基因。同时我们对已报道的IPA1、LAX1、HTD2、MOC1、D10和D3等分蘖相关基因进行了表达分析,发现这些基因在突变体lrt1中的表达水平大多发生了显著变化,表明LRT1是一个与水稻分蘖相关的新基因。这为进一步克隆该基因,并解析其调控分蘖的遗传机制打下了坚实的基础。
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