生化分析仪是一种生物医疗检测分析仪器，主要用于测定人的体液中各种生化指标。近年来，随着MEMS技术、生物化学技术和计算机技术的发展，生化分析仪有着微型化的趋势，而软件系统是微型生化分析仪实用化的重要组成部分。 本论文的工作得到国家自然科学基金重点项目和国家863项目的资助，在前期已开发出的半自动微型生化分析仪硬件平台的基础上，设计了一种操作方便、功能强、可扩展，具有中文用户界面的生化分析软件系统。本文主要进行了以下研究工作： 1．在查阅了大量文献、资料和调查了生化分析软件的使用及需求情况的基础上，分析了半自动分析仪硬件平台特点和优势，设计了软件系统的实现方案。 2．研究了信号处理、光谱分析、Windows程序设计、仪器分析、化学计量学的相关理论基础，实现了软件系统中生化分析数据的测量、处理、分析、存储和显示。 3．在了解临床检验学中常规检测方法和常用检测项目的基础上，在软件中实现了常规的检测方法，并设计了软件系统底层的数据库，实现了检测项目、历史数据和质控数据在数据库中的读取和存储。 4. 设计了软件系统底层的插件结构，增强了软件模块的可扩展性和互换性，使生化分析系统无需大的改动就能方便地应用于食品检测，环境监测等领域。 5．对生化分析系统进行了临床测试，并与医院检验科所使用的分析设备进行了对比，分析了实验结果。