首先，本文明确物流和物流运输系统的重要性，运用物流运输系统工程常用的仿真技术、系统最优化技术和分解协调技术，从系统论的角度将物流和物流运输系统作为一项系统工程来研究。 其次，在明确物流和运输的关系后，用系统工程的方法从现代物流运输方式优化组合的角度对运输工具的特点、运输工具的选择、运输线路的选择及现代物流运输方式进行分析，对物流运输合理化进行论述。 然后，分析物流运输系统中的单路径和多路径问题，利用系统工程的系统仿真理论，建立基于运输费用的单路径运输问题数学模型和多路径运输问题数学模型；基于运输时间的单路径运输问题数学模型和多路径运输问题数学模型；基于运输费用—时间的单路径运输问题数学模型和多路径运输问题数学模型。 最后，利用系统工程的最优化技术，对单路径运输问题数学模型和多路径运输问题数学模型进行仿真优化。