目的:通过检测慢性阻塞性肺疾病(Chronic obstructive pulmonary disease,COPD)患者和正常人载脂蛋白M(Apolipoprotein M,apoM)基因的多态性位点,应用碱基淬灭探针技术建立其三个突变位点rs805264、rs707922及rs707921的分型方法。方法:COPD患者和正常人样本各6例,通过罗氏454 GS Junior高通量测序仪对apoM基因进行测序分析,然后应用碱基淬灭探针技术建立相应的分型方法,并对252例COPD患者和248例正常人apoM基因rs805264、rs707922及rs707921三个突变位点进行检测,同时通过熔解曲线判断基因分型,并验证此方法的准确性。结果:罗氏454测序结果共发现19个高可信突变位点,其中有6个突变位点未被NCBI记载,但其突变频率均<20%,4个突变位点只发生在COPD患者中,rs751064723位点发生在转录本1第一外显子上,其余多数突变位点发生在apoM基因的启动子区和内含子区。熔解曲线分析结果显示rs805264、rs707922及rs707921三个位点野生型和纯合突变型分别在两个不同熔解温度出现熔解谷,杂合型则在两个温度均出现熔解谷。Kappa检验显示,检测结果与DNA测序结果完全一致(k=1,P=0.000)。结论:COPD患者apoM基因突变位点的发现,为进一步探讨apoM与COPD的关系提供了研究基础。构建的检测单核苷酸多态性方法简单、经济、准确,适用于大批量apoM基因分型研究工作。