近年来蛋白质组学已被广泛应用于神经科学的研究，通过这种研究可获得诸如蛋白质与蛋白质的相互作用及翻译后修饰等信息。海马是大脑皮层以下的一个特殊结构，它对来自不同感觉器官的信息进行整合，并在动物的学习和记忆中起着非常重要的作用。膜蛋白在海马细胞中扮演着重要的角色，如信号传递、物质转运、细胞识别、细胞运动、细胞免疫和代谢调控等。对膜蛋白的研究将会促进海马发生发展机制的理解，以及相关疾病的诊断和治疗。 本文以大鼠海马细胞为材料，匀浆后经过蔗糖密度梯度离心，收集37-41％之间的膜样品为研究对象，综合利用分级酶解与洗脱的方法进行了膜蛋白质组学分析。首先用胰蛋白酶直接在膜上预酶解，离心收集酶解释放的肽段，肽段经过反相色谱分级分离后进行CapLC-MS/MS质谱分析，共鉴定到525个非冗余蛋白质，其中膜蛋白占31.18％，整合膜蛋白(IMP)占10.84％。为了洗脱吸附在膜片上的肽段，又用两种不同的洗脱方法即常规洗脱和分级洗脱，用得到的肽段分别鉴定到133个和233个非冗余蛋白质，表明分级洗脱能够更充分地洗脱吸附肽段。经过分级洗脱的膜片继续用于脱氧胆酸钠(SDC)辅助的膜上酶解，离心收集的肽段经鉴定，共得到149个非冗余蛋白质，其中膜蛋白占57.7％，IMP占23.5％。最后，对残留膜片进行管胶酶解，并成功鉴定到83个非冗余蛋白质，61.45％是膜蛋白，31.33％是IMP。通过分级酶解与洗脱所鉴定的蛋白质经过严格地去冗余后，共鉴定到712个非冗余蛋白质，其中包括很多受体蛋白质、转运蛋白质、通信蛋白质、结构蛋白质及其它蛋白质。实验结果表明分级洗脱和酶解的整合应用可以很好地使膜蛋白得以分散并使低丰度蛋白质得以富集，有利于得到膜蛋白质组学研究的综合信息。