基于DNA纳米机器和等温扩增技术的白血病融合基因超灵敏检测新方法

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BCR-ABL1融合基因作为慢性粒细胞白血病(CML)的重要分子标志物,检测其表达水平对CML的早期诊断、疗效监测以及预后判断具有重要的临床意义。目前,BCR-ABL1融合基因的检测方法主要包括实时定量PCR、荧光原位杂交、流式细胞术等,但这些方法均存在操作复杂、耗时长且难以实现床旁检测等缺陷。因此,发展一种灵敏、快速、简便的BCR-ABL1融合基因检测新方法仍是亟待解决的难题。本研究基于靶物质诱导触发的高效DNA纳米机器和多引物样滚环扩增反应,构建了一种双重信号扩增荧光传感新策略,用于BCR-ABL1融合基因的超灵敏检测。本策略中,双单链DNA探针特异性识别BCR-ABL融合基因后,相互杂交自组装形成三交联T型纳米结构。在此结构基础上,聚合酶和切口内切酶联合驱动基于链置换反应原理的DNA纳米机器高效运转,产生大量剪切产物,形成第一重信号扩增。剪切产物作为引物激活下游滚环扩增反应。环状DNA模板上的双切口内切酶位点使得反应进入多引物样指数放大模式,形成第二重信号扩增,产生大量G4纳米酶,催化ThT进行荧光检测。双重信号扩增技术的高效联合实现了对BCR-ABL1融合基因的超灵敏检测,最低检测限低至5.52 fM,动态线性范围为10 fM到1 nM。本方法采用了“一酶多用”的反应方式,使得双扩增反应仅需一步加样操作,步骤简单,在60 min内即可完成检测。双探针识别模式有效避免了BCR基因、ABL基因等对检测的干扰,使得该方法在复杂基质环境中同样可以实现对加标样本的特异性检测,且回收率高。综上,本研究构建了一种超灵敏、高特异、高效、简便的BCR-ABL融合基因检测新策略,为临床CML的早期精准诊断提供了有力的技术支持,具有潜在的应用前景。
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