肛瘘患者肠道微生物多样性的检测和分析

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目的 本研究的目的是通过16S rDNA基因测序检测腺源性肛瘘患者粪便样本中的细菌种类,并与健康对照组进行比较,进一步揭示肛瘘的发生发展的相关机制。方法 采集30例腺源性肛瘘患者和30例无胃肠道疾病的健康对照组的粪便样本,提取细菌总基因组DNA,PCR扩增细菌16S rDNA基因序列的V4高变区。利用Illumina Miseq平台进行高通量测序,并进行数据分析。结果 Alpha多样性分析(ACE、Chao、Shannon和Simpson指数)显示,与对照组相比,肛瘘组的肠道菌群多样性持续丰富。Beta多样性分析显示,与健康对照组相比,肛瘘组的肠道菌群多样性更广泛。普雷沃氏菌属(4.9%vs.0.1%,P<0.01)、巨单胞菌属(3.9%vs.0.5%,P<0.01)和毛螺菌属(2.6%vs.0.1%,P<0.01)丰度较高,变形菌门(4.2%vs.10.9%,P<0.01)和肠球菌属(0.02%vs.9.3%,P<0.01)丰度较低。Veillonellaceae、Selenemondales和Negativicutes(均属于厚壁菌门)的主要菌株对这些类群差异的影响总体最大。结论 肛瘘患者与健康人群粪便样本中的细菌种类存在明显的差异,肛瘘组普雷沃菌属、巨单胞菌属、毛螺菌属丰度明显高于健康组,可能与肛瘘的发生发展有关。
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