核质互作雄性不育在甜菜生产中起着至关重要的作用,揭示核质互作雄性不育机理为以后的研究提供重要的理论依据。本研究是基于双向电泳(2-DE)结合质谱、非凝胶的label free结合质谱两种方法对甜菜核质互作雄性不育系N9849及保持系960766现蕾期的花蕾进行比较蛋白质组学分析,结果如下:1、基于2-DE结合质谱方法的蛋白质组学研究,成功鉴定到显著差异蛋白点21个,涉及8个功能类别,其中胁迫响应功能类别所占比例较大。在进行网络预测分析中,有6个蛋白点被连接在网络中,涉及胁迫响应、碳水化合物代谢、调控生长发育以及蛋白质合成四个功能组。2、基于label-free结合质谱的方法对差异蛋白质组学研究,成功鉴定到差异蛋白96个,涉及16个功能类别,其中胁迫响应,碳水化合物代谢,花粉发育等功能类别所占比例较大。在通路分析中共显著富集到4个通路,蛋白网络预测分析中,共富集到14个蛋白点,主要涉及蛋白质合成、胁迫响应等七个功能组。3、在鉴定到的差异蛋白中,胁迫响应,碳水化合物代谢,花粉发育等功能类别所占比例较大。胁迫响应功能蛋白类的谷胱甘肽-S-转移酶、过氧化氢酶等在不育系中显著低表达,有毒物质及活性氧的清除能力弱,可能导致不育系材料系统发生紊乱从而形成败育。碳水化合物代谢功能蛋白类的苹果酸脱氢酶,蔗糖合酶等在不育系中表达量较低,碳水化合物代谢强度低,能量代谢匮乏也是致使花粉不育的一个原因。花粉发育相关蛋白III型聚酮合酶在保持系中显著高表达,很好的维持了保持系的育性。本研究在蛋白质组学水平为阐明甜菜雄性不育机理及其利用提供理论依据。