【摘 要】
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目的:多胎萨福克羊是我国自主培育的优质多胎肉羊新品系,为探究其繁殖性状的分子机制,本研究利用全基因组重测序技术对多胎萨福克羊,及其父本品种萨福克羊和母本品种湖羊进行重测序,筛选繁殖性状相关基因,揭示育成种的遗传基础,为多胎肉羊新品种的选育提供依据。方法:（1）应用全基因组重测序技术对50只多胎萨福克羊、20只湖羊和20只萨福克羊进行重测序,利用群体固定指数（FST）和杂合度分析的方法进行全基因组选
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目的:多胎萨福克羊是我国自主培育的优质多胎肉羊新品系,为探究其繁殖性状的分子机制,本研究利用全基因组重测序技术对多胎萨福克羊,及其父本品种萨福克羊和母本品种湖羊进行重测序,筛选繁殖性状相关基因,揭示育成种的遗传基础,为多胎肉羊新品种的选育提供依据。方法:（1）应用全基因组重测序技术对50只多胎萨福克羊、20只湖羊和20只萨福克羊进行重测序,利用群体固定指数（FST）和杂合度分析的方法进行全基因组选择信号检测,解析品种特异的繁殖相关基因。（2）应用FST和杂合度分析方法检测多胎萨福克羊多羔组和单羔组繁殖差异基因。（3）将筛选到的MTNR1A作为繁殖性状候选基因,采用PCR-RFLP方法分析MTNR1A基因在多胎萨福克羊群体中的多态性,利用最小二乘法分析基因SNPs和单倍型与绵羊产羔数的关系。结果:（1）获得5,245.855G原始数据和5,236.338G高质量基因组数据。筛选到多胎萨福克羊繁殖相关基因WNT10A、SENP2、WNT6等14个,多胎萨福克羊特异基因ARHGEF4、CATIP、CCDC115等23个。（2）从多胎萨福克羊多羔组和单羔组中筛选到ADAMTS5、CAB39L和MTNR1A等28个繁殖性状相关基因。（3）以MTNR1A基因为繁殖性状候选基因,检测到MTNR1A基因exon2存在SNP1（Chr 26.15,099,314,G735A）、SNP2（Chr 26.15,099,296,G753A）和SNP3（Chr 26.15,099,204,C845A）,3个SNPs在多胎萨福克羊中均存在三种基因型。关联分析表明,SNP1的GG基因型、SNP2的GG基因型与多胎萨福克羊产羔数显著相关（P<0.05）,单倍型H1与产羔数极显著相关（P<0.01）。结论:（1）筛选出多胎萨福克羊特异的23个基因和87个SNPs。（2）筛选出多胎萨福克羊28个与繁殖性状相关基因和180个SNPs。（3）MTNR1A基因SNP1和SNP2位点GG基因型、单倍型H1可以作为多胎萨福克羊高繁殖力辅助选择的标记。
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