基于生物信息学分析AEBP1在胶质母细胞瘤中的表达及临床意义

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背景和目的:胶质瘤是成人中枢神经系统最常见的原发性恶性肿瘤,世界卫生组织(WHO)将胶质瘤分为I-II级的低级别胶质瘤和III-IV的高级别胶质瘤,其中高级别胶质瘤占成人原发脑肿瘤75%。胶质瘤中恶性程度最高的的IV级胶质瘤又被称为胶质母细胞瘤,5年生存率仅达10%。胶质母细胞瘤标准治疗方式主要为最大限度的手术切除肿瘤组织,以缓解肿瘤组织引起的颅内高压和神经精神症状,术后放疗同步联合替莫唑胺辅助化疗,但疗效有限,其致死率一直以来居中枢神经系统恶性肿瘤之首,中位生存期在15个月左右。脂肪细胞增强子结合蛋白1(AEBP1)最初被认为是负性调节脂肪生成的转录抑制剂。随后越来越多研究表明,AEBP1在多个肿瘤中发生发展中发挥重要的作用,认为AEBP1可能是一个原癌基因。但目前国内外关于AEBP1在胶质母细胞瘤中作用的研究甚少。本研究拟通过对各类数据库综合挖掘,探究AEBP1在胶质母细胞瘤中的表达及对患者预后等影响,并对AEBP1在胶质母细胞瘤中可能的功能和作用信号通路进行预测,以期从新的视角进一步阐明胶质母细胞瘤发生发展过程中的可能机制,为寻求胶质母细胞瘤治疗潜在的有效靶点、延长患者生存期提供依据。方法:通过Oncomine数据库和GEPIA网站分析AEBP1 mRNA在胶质母细胞瘤中表达水平;应用GEPIA网站及下载的TCGA数据分析AEBP1 mRNA表达水平与各临床病理特征的相关性及对患者预后等影响;随后在人类蛋白质图谱(HPA)数据库进一步分析AEBP1蛋白在胶质瘤表达情况;进一步在cBioPortal数据库中找出AEBP1的共表达基因,应用Web Gestalt在线工具对AEBP1及其共表达基因行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:Oncomine数据库筛选出的7项数据集和GEPIA网站分析均显示AEBP1mRNA在胶质母细胞瘤组织中表达较正常脑组织上调,差异有统计学意义(P<0.01);GEPIA网站生存分析显示AEBP1 mRNA高表达的患者整体生存期(OS)较低表达患者降低,差异有统计学意义(P=3.9×10-5);进一步TCGA数据库分析示AEBP1 mRNA表达水平与异柠檬酸脱氢酶1(IDH 1)突变与否相关(P=0.005),且是胶质母细胞瘤患者OS的独立影响因素(HR=0.5631,95%CI,0.3902-0.8127,P=2.16×10-3);HPA数据库同样证实AEBP1蛋白在胶质瘤组织中阳性表达;最后KEGG通路富集分析显示AEBP1及其共表达基因主要富集的通路包括Hippo、NF-κB、TNF等信号通路。结论:AEBP1在胶质母细胞瘤中高表达,且AEBP1 mRNA高表达是胶质母细胞瘤患者的独立预后因素;Hippo、NF-κB、TNF等信号通路可能是AEBP1过表达促进胶质母细胞瘤发生发展的重要通路。AEBP1可能作为胶质母细胞瘤患者治疗的潜在靶点。
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