人染色体17p13.3缺失区内潜在肝癌相关基因HC63R转录调控机制的初步探讨

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HC63R基因(GeneBank登录号:AF246287)是在肝癌高杂合性缺失(LOH)17p13.3区域内定位克隆到的一个重要基因.该基因全长近300kb,含有18个外显子,其cDNA长2,078bp包含有2022bp的开放阅读框,编码含673aa的蛋白产物.为了探讨该基因在转录水平的基本调控机制,并分析该基因的转录调控与肝癌发生的关系,该论文对HC63R基因的转录调控进行了以下的研究.1)应用半定量RT-PCR的方法检测HC63R基因在肝癌组织/癌旁组织,正常肝组织及多细胞系中的表达水平;2)采用引物延伸法(primer extension)确定该基因的转录起始点;3)通过系统性的限制性内切酶酶切与连接扫描突变,构建一系列含有由该基因启动子的缺失或突变体控制的报告基因的质粒,通过瞬时转染与荧光素酶报告基因检测,初步分析了与该基因表达有关的启动子的关键序列;4)应用共转染以及电泳迁移率改变检测法(electrophoretic mobility shift assay,EMSA)对该基因启动子所包含的重要的顺式元件以及有关的反式作用因子的性质作了初步的探讨.
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