随着经济全球化和区域一体化进程加速，以加快跨区域合作、联手打造世界级的经济社会共同体作为目标的中心城市、国际大都会、核心湾区等正在迅速崛起，“共建”、“合作”已成为新形势下各国家和地区对外开放、参与国际经济合作、实现和平可持续发展的国家战略。2002年，广东在南沙召开省委省政府南沙开发现场会，正式启动南沙开发建设，2009年全国“两会”上,粤港澳合作首次写入了政府工作报告,2011年年初，国家“十二五”规划纲要在强调粤港澳重点合作区域打出南沙、前海和横琴“三张牌”，其中，南沙新区以独特的区位优势、发展潜力成为担负“深化粤港澳合作，建设中华民族共同家园”历史使命的重要载体，南沙定位的转变，将促使南沙新区发展战略产生重大变化。本文以南沙新区粤港澳全面合作的政府对策为研究对象，从政府公共管理和政府决策的角度出发，采用问题与对策研究的具体案例，结合南沙区推动与港澳合作的发展历程、现状及未来重点工作思路，分析推进南沙新区粤港澳合作现状与问题、必然性和政府对策等。同时，分析跨区域合作模式，借鉴国内外湾区及国际大都会发展经验和有关学者的研究成果，特别是有针对性地对深圳前海湾保税港区、珠海横琴新区、福建平潭综合实验区等地开展跨区域合作经验进行深入分析，从组织机构、制度建设、社会参与等方面对推动南沙新区粤港澳合作提出对策和建议。