日本帝国主义者在1937年7月发动全面侵华战争后，不仅霸占中国领土，掠夺中国资源，残杀中国人民，而且公然违背《日内瓦协定》在中国大肆进行细菌作战。在侵华日军的各支细菌部队中，成立于1939年4月18日的南京荣字1644细菌战部队是其中一支十分重要的细菌部队，它由石井四郎带领731部队的一部分人员与设备器材来南京创建的。南京荣字1644细菌部队不仅是侵华日军细菌战研发的主力细菌部队之一，同时由于特殊的地理位置，其在侵华日军细菌作战中充当了十分重要的角色。但是，由于南京荣字1644细菌部队活动的隐蔽性，加之战后日本政府对侵华日军细菌战罪行的隐瞒，长期以来中外学者对南京荣字1644细菌部队的真实面目仍不甚了解。 本文根据日本方面和南京第二历史档案馆馆藏的资料，以及近几年来国内专家学者对宁波细菌战、常德细菌战、浙赣细菌战的调查资料，试图对南京荣字1644细菌部队的建立、内部组织结构与运作和细菌作战等方面做一全面的阐述。