准确理解与描述金融市场的互相关性，一方面有利于市场参与者与监管者捕捉市场信息以及制定经济政策；另一方面有助于理解金融资产价格的形成机理，对金融资产的优化配置与风险管理具有重要的实践指导意义。金融市场内外个体之间的相互作用是复杂变化的，导致了金融市场的内外运行机制与规律难以准确地描述与刻画。因此，考虑到金融市场是复杂的动力系统，本文以复杂系统理论为分析基础，具体从分形分析理论、复杂网络理论以及随机矩阵理论三方面进行金融市场互相关性度量的研究。在金融市场互相关性度量的机理分析部分，首先界定金融市场及其互相关性等概念，并给出目前互相关性度量方法的不足；其次，分析金融市场互相关性的既定特征，包括非线性、自相似性、复杂性、动态性等，为寻求能够有效度量金融市场互相关性的理论与方法提供线索与思路；最后，讨论基于复杂系统理论的金融市场互相关性度量方法。在金融市场互相关性度量方法及其实证研究方面，本文基于分形分析理论、复杂网络理论、随机矩阵理论分别研究两个金融市场的互相关性、多个金融市场的互相关性、金融市场内的互相关性。首先，基于分形分析理论，主要展开三方面的研究：一是通过降趋势互相关分析(DCCA)法以及DCCA系数法考察人民币及其货币篮子中4个主要货币(即美元、欧元、日元、韩元)之间的互相关性。实证表明，它们之间的互相关性呈现出弱的持久性；并发现这4个货币在人民币货币篮子的权重的顺序依次为USD EUR JPY KRW；二是通过多重分形降趋势移动平均互相关分析法研究沪深300股指现货市场与期货市场的互相关性，发现两个市场之间的互相关性呈现多重分形与非线性特性；并基于滑窗分析法，动态分析互相关尺度指数的演化特征，发现两个市场的互相关性呈现长程持久性；三是提出降趋势最小方差(D-MV)套期保值比率方法，可以在不同时间尺度下设定套期保值比率，它定义为现货与期货收益率的降趋势协方差函数与期货收益率的降趋势方差函数的比值。模拟与实证分析发现D-MV套期保值方法的套期保值性能在绝大多数时间尺度下要优于MV套期保值方法。其次，基于复杂网络理论，从时间层面的不同划分展开了三方面的研究：一是提出基于动态时间弯曲方法与最小生成树(MST)法的互相关性网络构建方法，以研究美国次贷危机背景下的全球外汇市场的互相关性及其网络的拓扑特征。具体地，实证分析全球外汇市场网络在美国次贷危机前、中、后三个阶段的拓扑与市场性质。实证发现，经历危机之后，网络的拓扑结构相对于危机前变得更为稳健，此时新加坡元成为网络的中心节点之一；二是提出基于DCCA系数法与MST法的多尺度互相关性网络构建方法，以研究不同时间尺度下的全球外汇市场的互相关性及其网络的拓扑与统计性质。实证发现，全球外汇市场网络在不同时间尺度下呈现不同的拓扑与统计性质，在绝大多数尺度下呈现无标度特性；三是提出基于时变Copula法与MST法的时变互相关性网络构建方法，以研究动态时变的全球外汇市场的互相关性及其网络的拓扑与统计性质。实证发现，全球外汇市场网络具有长程记忆性，且在大多数时候是无标度网络。全球外汇市场汇率间的紧密关系在短期内很难被打破具有很强的稳健性，而它的长期稳定性则随时间的增加而急剧下降。最后，提出结合DCCA系数法与随机矩阵理论的方法，以研究不同时间尺度下美国股票市场内部的互相关性及其统计性质。实证发现，不同时间尺度下的互相关矩阵呈现出不同的统计性质，这将有利于资产的风险管理以及最优资产组合的选择，特别是资产组合的多样性。