长非编码RNA LINC00707调控胃癌细胞增殖和转移的机制研究

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近年来,研究表明,长非编码RNA(long noncoding RNAs,lncRNAs)不仅在机体的正常发育、分化等生理过程中发挥重要调控功能,其异常表达与疾病(包括肿瘤)的发生发展有着密切的联系。胃癌是最常见的恶性肿瘤之一,许多lncRNAs在胃癌的恶性进程中表达紊乱,充当原癌基因或抑癌基因的角色。在本研究中,我们通过分析GEO数据库(Gene Expression Omnibus)中一份胃癌病例-对照芯片数据(GSE58828)发现,长非编码RNALINC00707在胃癌组织中表达显著上调;同时对TCGA数据库(The Cancer Genome Atlas)中30例胃癌患者癌和癌旁组织中LINC00707的表达量进行分析统计发现LINC00707在胃癌组织中表达上调;qRT-PCR对以上结果进行了验证。LINC00707基因定位于人类10号染色体,其转录本长度是3087bp。高表达的LINC00707与胃癌患者的肿瘤大小、分期、淋巴结转移以及患者预后密切相关。细胞功能学实验结果表明,在胃癌细胞系中敲低LINC00707的表达抑制胃癌细胞增殖和转移能力,促进胃癌细胞凋亡;动物实验结果证实干扰LINC00707的表达抑制胃癌细胞的肿瘤形成能力。进一步对GEO数据库中一份测序结果(GSE29779)和生物信息学分析发现,LINC00707与RNA结合蛋白HuR高度结合,RNA-pulldown和RIP实验对结果进行了验证。在胃癌细胞中分别干扰LINC00707和HuR后进行转录组高通量测序发现,有276个基因均在下调LINC00707和HuR后差异表达,并对其进行GO分析和KEGG通路分析,发现这些基因大多与细胞间粘附、细胞转移、细胞增殖以及凋亡等生物学过程相关。通过对靶基因筛选发现,VAV3、PDGFRB、GLI1、F11R、NRXN2、TNFRSF10C、WNT6 等癌基因可能是LINC00707和HuR共同调控的靶基因。已有文献报道lncRNAs与HuR结合后,进一步绑定在靶mRNA的3’UTR区,提高靶mRNA的稳定性和蛋白的翻译能力,促进肿瘤发生发展。因此,为探讨LINC00707和HuR绑定后是否直接调控靶mRNA,利用生物信息学和RIP实验证实,HuR与VAV3、F11R基因的转录本高度结合,提示“LINC00707-HuR-靶mRNAs(VAV3、F11R)”调控模式形成,促进胃癌细胞增殖和转移。在胃癌细胞系中进一步封闭HuR后抑制胃癌细胞增殖和转移能力,与敲低LINC00707的生物学功能一致。综上结果表明:LINC00707在胃癌细胞中发挥原癌基因的作用,参与胃癌的恶性进程,并可能作为胃癌患者诊断和预后的分子标记物。
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