LAMP实时浊度法快速检测肠出血性大肠杆菌O157的研究

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肠出血性大肠杆菌(EHEC) O157发病率越来越高,已经被世界卫生组织列为新的病原菌。而大肠杆菌的传统检测方法消耗时间长、步骤多而复杂,因此开发高效、快速、特异性高的鉴定方法,已经成为当务之急。在分子生物学水平上来研究EHEC O157的核酸结构和分子特征,采用环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)方法来进行检测EHEC O157,将可能取代PCR检测成为大肠杆菌O157快速检测的发展方向。LAMP实时浊度法是利用浊度仪全程监控等温扩增过程,主要通过LAMP扩增反应过程中会产生的一种白色沉淀副产物焦磷酸镁,与反应液中靶基因得到扩增的量成正比,通过沉淀产生的起始时间判断反应的进行的程度。本研究主要针对EHEC O157的抗原基因rfbE和产Vero毒素的毒力基因stx1和stx2,设计特异性的LAMP引物对。经条件优化后确定最适反应体系为,内引物(FIP和BIP)各1.6μM、外引物(F3和B3)各0.2μM、20mM Tris-HCl(PH8.8)、10mM KCl、8mMMgSO4、10mM(NH4)2SO4、0.1%Tween20、0.8M甜菜碱、8mM MgSO4、1.4mM dNTP、8U Bst DNA聚合酶和2μl DNA,63℃恒温反应60min以及在80℃下5min结束反应。使用优化后的系统进行LAMP反应以确定3种引物的特异性、稳定性及灵敏度,研究结果显示,该方法的最低检出限为l03CFU/mL,比普通PCR法灵敏度提高100倍,可以检测添加菌量为100CFU/25g(mL)的样品。运用此法对珠海地区的200份食品样品进行检测,为食品风险评估提供了基础数据。LAMP实时浊度法解决了常规的LAMP法只能对反应终点进行检测的缺陷,它能对整个反应过程进行实时监控,无需通过凝胶电泳分析反应产物,使方法所得数据准确可靠,效率高,同时具有操作简单、灵敏快速等优势,是食品中致病微生物快速筛检的一种良好方法。
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