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黄酮含量是影响花生籽仁营养价值的重要指标,常用的分光光度法及色谱法测定黄酮含量费时费力,不适于育种过程中大批量的检测,构建其近红外测定模型可为快速检测籽仁黄酮含量提供重要的技术保障。本研究以290份不同黄酮含量的花生种质为材料,利用Al3+显色法测定的黄酮含量。使用瑞典波通DA7250型号的近红外分析仪（950-1650 nm）扫描和采集花生籽仁的近红外光谱值,选用全波长光谱范围内偏最小二乘回归法（Partial Least Squares Regression,PLSR）,对比单一和复合不同的预处理方法,比较不同模型的相关系数和误差来预测最佳模型。建立了花生籽仁的黄酮含量的近红外光谱定标模型,并进行了外部验证。以四粒红与冀农黑3号为亲本的RIL群体和美国花生微核心种质构成的自然群体为供试材料,分别测定新鲜籽仁（Fresh seeds,FS）与干燥成熟籽仁（Dry Maturation Seed,DMS）中的黄酮含量;利用本实验室构建的遗传连锁图谱和基因组测序数据,结合获得的表型数据对RIL群体进行数量性状位点（Quantitative trait locus,QTL）定位,对自然群体进行全基因组关联分析（genome-wide association study,GWAS）。主要结果如下:1.花生籽仁黄酮含量定标模型的构建与验证。290份不同花生样品的吸收峰强度不同,花生籽仁黄酮含量变幅在46.96～140.18 mg RT/100g,平均值为91.37 mg RT/100g,变异系数为 17.48%。比较 Savitzky-Golay Derivative、SNV、Baseline、De-trending 等 不同光 谱预处 理方法 对近红 外光谱 的影响。结果 表明,Savitzky-Golay Derivative的组合光谱预处理方法所建模型效果最佳,该模型的校正集相关系数（Rc）为0.884,校正均方根误差（RMSEC）为4.998。利用50份花生样品对该模型进行外部验证,预测相关系数Rp为0.904,预测均方根误差RMSEP为1.122。2.鉴定RIL群体和自然群体花生籽仁黄酮含量。3年6个环境下RIL群体DMS黄酮含量范围为44.01～141.95 mg RT/100g,变异系数范围为13.69%～17.62%。FS黄酮含量范围为10.65～65.53 mg RT/100g,变异系数范围为20.30%～27.37%。在自然群体中,DMS、FS 黄酮含量范围分别为 86.72～140.18 mg RT/100g、17.93～46.70 mg RT/100g,变异系数分别为10.30%和17.74%。3.基于RIL群体高密度遗传图谱进行了花生籽仁黄酮含量QTL定位,共鉴定到12个DMS黄酮含量相关的加性QTLs,分布于A01、A04、A08、B01、B07、B08、B09等7条染色体上,LOD值介于2.53～4.51,表型变异解释率为4.76%～10.23%;定位到3对上位性QTL,这些位点分布于A03、A07、B05、B09染色体,LOD值介于5.11～5.22,表型贡献率范围为11.70%～14.52%。共检测到17个FS黄酮含量相关的加性QTLs,分布在A01、A05、A08、B05等4条染色体上,LOD值介于2.51～2.88,表型变异解释率为5.40%～10.81%,定位到1对上位性QTL,位于B03、B04染色体,LOD值为5.08,表型变异解释率为10.88%。4.利用美国花生微核心种质组成的自然群体进行了花生籽仁黄酮含量全基因组关联分析,共检测到13个DMS黄酮含量相关的SNPs,分别位于A03、A05、B05、B06、B10染色体上,在A03染色体上物理位置为8549457,A05染色体上4个位点物理位置在46111930～66070243之间,B05染色体上物理位置为142219082和145032033,B06染色体上物理位置为14232542,B10染色体上5个位点物理位置在26604370～108920014之间,贡献率为10.09%～14.52%。共检测到32个FS相关的SNPs,分别位于A01、B01、B05染色体上,在A01染色体上24个位点物理位置在12430086～90568649之间,B01染色体上6个位点物理位置在18372406～137044543之间,B05染色体上物理位置为3696019和3696048,对表型贡献率为11.46%～14.17%。本研究所建立的花生籽仁黄酮含量近红外光谱模型可以无损、快速地检测花生籽仁中的黄酮含量,为高效鉴定花生籽仁黄酮含量奠定了基础,并为低含量物质的近红外模型构建提供借鉴。利用RIL群体对DMS、FS黄酮含量相关QTLs进行了分析,共检测到2个主效QTL,同时利用美国微核心种质构成的自然群体对DMS、FS黄酮含量进行了 GWAS,筛选出大量与黄酮含量相关的SNPs。QTL与GWAS结果均在A01、A05、B01、B05等4条染色体上定到了相关位点。这些结果不仅为花生黄酮含量的分子标记辅助育种打下了坚实基础,同时,也为花生籽仁黄酮含量性状的遗传解析提供了理论依据。