珊瑚礁生态系统物质流通高效迅速，具有极高的生物多样性与生物生产力。桡足类是浮游动物的重要类群，在海洋食物链中承担着物质与能量向更高营养级传递的媒介作用。本论文以三亚珊瑚礁海区的桡足类优势种为研究对象，运用分子生物学技术，以18SrDNA为目标基因，研究自然海域中桡足类摄食的现场食物组成多样性及其摄食节律，进而探讨桡足类在珊瑚礁生态系统中的生态功能。取得了以下研究结果:　　 1、桡足类现场摄食研究方法的建立　　 建立了桡足类现场摄食样品保真采集、保存及DNA有效提取方法，设计并筛选了回避桡足类却能扩增其他真核生物18SrDNA的引物（扩增片段长度～0.8kb），并筛选出最佳的PCR扩增程序。该引物可成功扩增33种不同门类的真核生物，包括:硅藻、甲藻、绿藻、金藻、红藻、黄藻、软体动物、珊瑚、毛颚类动物;但不能扩增检测的桡足类。运用该方法成功检测了自然现场水样生物组成，包括:硅藻6属(47％)、甲藻2属(21％)、后生动物(24％)及金藻与隐藻等其他生物(9％)，其中根管藻(28％)、裸甲藻(31％)和原甲藻(13％)所占比例较大，结果与显微镜检基本对应。以微刺哲水蚤(Canthocalanuspauper)为目标种，在其肠道中成功检测到甲藻(88％)、后生动物(6％)、原生动物(3％)和隐藻(3％)，证明此方法可以运用于现场桡足类摄食多样性研究。　　 2、桡足类优势种现场摄食多样性　　 2010年7月于三亚珊瑚礁海区采集了浮游生物样品，浮游植物共15属26种，主要为硅藻（13属24种）和甲藻（2属2种），根管藻最多，丰度达1.27×104cells/L;浮游桡足类是网采浮游动物的主要类群。以桡足类优势种亚强次真哲水蚤（Subeucalanussubcrassus）、微刺哲水蚤（Canthocalanuspauper）、锥形宽水蚤（Temoraturbinata）为目标种，分析其肠道食物组成。发现食物分属于陆生植物、原生动物、真菌和后生动物等不同门类，其中锥形宽水蚤、微刺哲水蚤和亚强次真哲水蚤分别检测到9、13、7种食物类型，杂食指数分别为0.79、0.86、0.6，多样性比通常认为的要高。陆生植物Ficus-like、后生动物Farfantepenaeus-like和海洋真菌Cladosporium-like是三种桡足类共有的食物类型。三种桡足类都表现出对某种食物的偏爱性，微刺哲水蚤和亚强次真哲水蚤偏植食性，陆生植物分别占到食物组成的50％和55％，而锥形宽水蚤偏食原生动物(50％)。在肠道中并未检测到浮游植物，而陆生植物和原生动物在三种桡足类的食物组成中占据较大比例。　　 3、优势种亚强次真哲水蚤摄食节律　　 2011年5月采自珊瑚礁海区的昼夜样品(早6:30-7:30，中12:30-13:30，晚19:30-21:30)中，共鉴定浮游植物种类35种，包括:硅藻、甲藻、金藻、蓝藻。硅藻占据优势地位，分别占到早、中、晚总密度的74％、96％和52％。早、中、晚的浮游植物总细胞密度呈现递增趋势。亚强次真哲水蚤早、中、晚的食物组成有明显差异:早上的摄食多样性最低，仅有原生动物(96％)和后生动物(4％)，偏肉食;中午的多样性高，包括底栖硅藻(4.2％)、甲藻(75％)、陆生植物(8.2％)、原生动物(8.4％)和后生动物(4.2％)，杂食偏植食;晚上的食物组成有原生动物(92％)、硅藻(4％)和后生动物(4％)，偏肉食。呈现出明显的早晚偏肉食、中午偏植食的节律特点。食物组成中原生动物较多，可高达90％，陆生植物仍有出现。　　 4、桡足类生态功能探讨　　 陆生植物占据桡足类食物组成的主要部分，其来源可能为陆源输入的植物碎屑或植物花粉扩散，在水体中以颗粒有机物(POM)的形式存在。由此推测在珊瑚礁生态系统中，浮游植物并不是桡足类主要的食物，而有机颗粒物(POM)可作为重要的食物成分而被直接利用。桡足类通过摄食作用，一方面增加了有机物的利用效率，另一方面也可加速生源要素的生物地球化学循环过程，从而对维持珊瑚礁生态系统的物质循环起到重要作用。