基于宏基因组学测序的肠道菌群与非小细胞肺癌相关性研究

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目的:肠道微生物群通过代谢、炎症和免疫反应在肺癌的发生和进展中起着重要作用。非小细胞肺癌(NSCLC)患者经化疗和免疫治疗后,肠道菌群会发生紊乱。本研究拟从NSCLC患者肺部肿瘤放疗前后的菌群变化中找出肠道菌群与临床指标的相关性,为NSCLC的诊断和防治提供新思路。方法:筛选四川省肿瘤医院10例经病理学诊断为非小细胞肺癌的初治患者,分别于治疗前、15次胸部肿瘤放疗后收集粪便样本,检测炎症标志物,提取粪便标本基因组DNA,构建文库后用Illumina Hiseq2000双端测序,测序数据进行Metagenome组装,数据库比对后基因预测,对应物种注释及基因功能预测分析等步骤进行肠道微生态群落及代谢功能的研究分析。用SPSS 19.0软件进行统计学分析。结果:1.研究对象情况共入组10例患者,其中男性6例、女性4例;病理分型:腺癌5例、鳞癌4例、未分化癌1例;分期:ⅢA期3例、ⅢB期1例、ⅢC期3例、ⅣA期3例;经放射治疗后疗效评价:部分缓解(PR)6例、进展(PD)4例。2.NSCLC患者肠道菌群与临床特征相关性本研究显示,肠道菌群与患者年龄、吸烟、病理类型、营养状况、炎症标志物(中性粒细胞/淋巴细胞比例、血小板/淋巴细胞比例及淋巴细胞/单核细胞比值)无相关性。3.NSCLC患者放疗前后肠道菌群多样性变化(1)生物标志物的多级LEfSe分析发现放疗后有害菌增加,放线菌(LDA值:4.2>4)及链球菌(LDA值:5.23>4)丰度增加具有显著差异。(2)门水平,拟杆菌门在放疗后丰度均增加;厚壁菌门和拟杆菌门占比最高,在放疗后两种菌门丰度占比发生优势互换。属水平上,放疗后双歧杆菌属有下降。(3)各样本肠道菌群多样性改变与肿瘤对放疗敏感性无相关性。4.肠道菌群的稳定性本研究中患者肠道菌群首次取样后,与患者在肺部放疗、饮食结构改变、间隔超过20天等因素下再次取样比较,通过Bray-Curtis距离矩阵进行样品间聚类分析,同一样本微生物会保持原有的组成结构及丰度。结论:本研究发现,NSCLC患者胸部放疗后肠道菌群多样性会发生改变,改变趋势为有害菌增加,有益菌减少。NSCLC患者肠道菌群多样性与吸烟、年龄、临床分期、病理类型、营养状况、炎症标志物(中性粒细胞/淋巴细胞比例,血小板/淋巴细胞比例及淋巴细胞/单核细胞比值)无相关性,肠道菌群放疗后的多样性改变与放疗敏感性无显著相关性。肠道微生物的菌种结构组成及丰度在外环境改变后仍具有自身稳定性。
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