水稻中LATERAL ORGAN BOUNDARIES domain基因家族进化分析

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植物特有的LATERAL ORGAN BOUNDARIES(LOB)domain基因家族在侧生组织的发育中起着潜在的作用。为了了解水稻中的LOB domain(LBD)基因(OsLBD)家族在进化上的特征,基于现有的水稻两亚种数据库,35个粳稻(日本晴)LBD基因(命名为OsJLBD)和相同数量的籼稻(9311)基因(命名为OsILBD)被鉴定出来。与拟南芥中的LBD基因(AtLBD)相似,OsJLBD和OsILBD基因也有两个类别(class Ⅰ和class Ⅱ)。在水稻的两亚种中都发现一种新的水稻LBD基因有着两个LOB domain,并被预测出有两个盘绕圈的结构,这可能是水稻所独有的。OsJLBD和OsILBD基因有相似的染色体分布图。OsJLBD和OsILBD基因都可被分为5个亚类(class Ia,Ib,Ic,Id,和class Ⅱ),且没有亚类有特殊的表达谱。OsJLBD和OsILBD亚家族中所有的class Id基因都被预测没有内含子。自拟南芥以来,水稻LBD基因家族的进化经历了亚家族平行进化和重复基因的缺失这个过程。
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