利用环境中原位微生物进行水环境的治理和修复,是既经济又可避免二次污染的绿色技术,因此充分了解受污染河流中微生物绝对数量及群落结构,不仅可以判断污染物对水环境的影响,而且通过人工参与改变环境条件,将有助于受污染河流的治理,提高自净效率。近年来,随着分子生物学技术的日趋成熟及其在环境微生物检测分析中的应用,使得水环境中自然微生物种群、绝对数量的原位测定得以实现。本研究以第二松花江吉林市段某一污染江段为研究对象。首先对采集的水样进行SS和COD的测定,对浮游微生物和附着微生物进行DNA提取,然后对微生物长期进化过程中、高度保守并保持着高度“家族特异性”序列或结构的16S rRNA进行常规PCR扩增和纯化,运用Real-time PCR技术采用四步法进行绝对定量,应用克隆技术及比对NCBI中的GeneBank鉴定微生物种类,并建立16S rRNA基因文库。通过微生物绝对数量检测、种类鉴定及受污染河段水质的常规化验,探讨微生物种类随水质空间变化的关系,从另一个角度反映了微生物对水体净化所起作用。研究结果表明在第二松花江吉林市段某一污染江段中,附着微生物主要是耐低温且喜营养丰富环境的变异直链藻(Melosira varians),结构较单一;背景值上游水样出现致病菌气单胞菌属(Aeromonas),上游已受污染。浮游微生物在纵向50-100m、横向20-90m区域内大量繁殖,附着微生物数量在下游100m处出现峰值,为46.2μg/μl。