江口萝卜猪CaN基因对CFL2基因表达调控及肉质影响规律研究

来源 :贵州大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:zuaixin2
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
CFL2基因是肌动蛋白解聚因子(ADF/cofilin)家族成员cofilin在骨骼肌中的主要编码基因,cofilin具有调节肌动蛋白装配的功能,对肌肉发育和肌肉再生起重要作用,因此CFL2基因可能对畜禽肉品质有直接的影响。钙调磷酸酶(Ca N)是一种受Ca2+离子调节的蛋白磷酸酶,Ca N是cofilin上游重要的调控分子,是由催化亚基(Cn A)和调节亚基(Cn B)组成的异源二聚体。在肌肉组织中,Cn A和Cn B主要由PPP3CA和PPP3R1基因编码。Ca N作为一种效应分子参与多种细胞功能的调节,并且已被证明在肌纤维的类型转化上有重要影响,对于畜禽肉质有调控作用。本研究以贵州优良地方品种江口萝卜猪为试验对象,以直接测序法检测Ca N编码基因PPP3R1和PPP3CA基因与CFL2基因上的SNPs位点并进行生物信息学分析,并对各位点分型,测定11项肉质指标和不同基因型个体背最长肌中3个基因的表达量,研究SNPs位点和肉质指标、基因表达量之间的相关性以及PPP3R1和PPP3CA基因与CFL2基因表达之间的相互调控关系。另外还测定了不同月龄江口萝卜猪9个主要组织中的基因表达量,研究PPP3R1、PPP3CA和CFL2基因的时空表达规律。获得主要结果如下:1、CFL2基因上检测到2个SNPs位点,为CFL2-A-397G和CFL2-G163C,分别位于启动子和5’UTR,CFL2-A-397G位点会使转录因子结合位点数量增加。CFL2-G163C会使m RNA二级结构稳定型有所增强。CFL2-A-397G位点野生型(AA)肉色显著高于杂合型(AG),野生型猪肉质好于杂合型猪。CFL2基因在背最长肌中的表达量和与肉色为显著负相关,与剪切力为显著正相关。CFL2-A-397G位点变异会导致CFL2基因表达量显著上升,同时PPP3R1基因表达量显著下降。CFL2基因在心脏中表达量最高;其次在背最长肌、腰大肌、十二指肠和胃中都有较高的表达量;在肺、脾和肾中表达量较低。CFL2基因在背最长肌、十二指肠、胃、心以及腰大肌中表达量随着月龄大幅上升,在肝中的表达量随月龄有小幅度上升趋势。2、PPP3R1基因检测到3个SNPs位点,分别为PPP3R1-G-1119T、PPP3R1-A-1134C、PPP3R1-C-1310T,均位于启动子。PPP3R1-A-1134C位点位于预测到的一个高分核心启动子区内,且位于一个启动子标志性元件TATA框中。PPP3R1-A-1134C位点野生型(AA)肉色显著高于杂合型(AC)和突变型(CC),野生型猪肉质优于另外两种基因型猪。PPP3R1-A-1134C位点变异导致基因表达量下调,突变型(CC)个体表达量显著低于野生型(AA),但对CFL2基因表达无显著影响。PPP3R1基因在骨骼肌中的表达量最高,显著高于其余组织;心脏中表达量最低,显著低于其余组织;其余组织中表达量差异不大。在背最长肌、十二指肠、胃以及腰大肌中可以看到有随月龄上升的趋势。在十二指肠中,不同月龄表达量差异显著。3、PPP3CA基因检测到3个SNPs位点,PPP3CA-A-918C位于启动子,PPP3CA-G154767A和PPP3CA-G316451A位于外显子,为同义突变。PPP3CA-A-918C位点预测到的位于核心启动子区附近,PPP3CA-G316451A位点对m RNA二级结构无影响,PPP3CA-G154767A位点会使m RNA二级结构稳定型增强。PPP3CA-G316451A位点野生型(GG)和杂合型(GA)大理石纹评分显著高于突变型(AA)。PPP3CA基因在背最长肌中的表达量与p H24为极显著正相关。PPP3CA基因在骨骼肌和脾中表达量较高,均显著高于其余组织,其次为脾。其余组织除肾脏相对较低之外,总体差异不大。背最长肌、心和腰大肌中的表达量随月龄大幅上升,脾中随月龄小幅上升但月龄增加上升幅度越来越小。4、背最长肌中CFL2基因的表达量与PPP3R1基因的表达量呈显著负相关,且CFL2基因表达量显著提高时,PPP3R1基因表达量显著下降,但PPP3R1基因表达量显著下调时,CFL2基因表达量无显著差异,说明CFL2基因表达量改变对PPP3R1基因表达量有明显的影响,而PPP3R1基因表达量改变对CFL2基因表达量无影响。
其他文献
专利本身就具有排他性,当专利成为行业技术标准后(即转化为该行业的标准必要专利),使得专利成为生产某种商品或者符合某种行业技术标准所必然采用的技术,更加增强了专利的垄断性。同时,标准必要专利具有一定的特殊性:一方面,标准必要专利持有人可能会利用其特殊地位故意申请禁令救济以此来增加己方在商业谈判中的筹码,以便争取更高的专利许可费或额外增加一些不合理的专利许可使用要求,产生“专利劫持”的现象;另一方面,
动态精密单点定位技术是一种新的GPS精密单点定位方式,其原理是利用IGS(In-ternational GNSS Service)精密星历和精密钟差对单台GPS双频接收机的观测数据进行动态非差处理,以达
Milicic已经对导出范畴及其上同调函子展开研究,并得到许多很好的结果.本文将构造一类新的范畴——准严格P-半Abel范畴,并从整体的角度研究相关性质.本学位论文分为两个部分.
目的:我们团队曾基于对古代中风分类系统的研究提出了《中风临床诊断框架的构建》,本研究的目的是在这一新的框架下,探索急性缺血性中风不同诊断分类的中医证候要素特征、磁共振影像学特点及TOAST分型之间的差异,为认识潜在的病因学提供依据。方法:连续收集2017年1月至2018年12月于北京中医药大学东直门医院脑病科就诊并诊断为急性缺血性卒中的住院患者456例,按照《中风临床诊断框架的构建》提出的中风诊断
水稻是世界上重要粮食作物之一,随着社会进步与生活水平的提升,人们对于稻米的品质需求,不仅注重口感等特质,而且要求水稻中富含多种功能营养物质,功能性水稻可以满足人们的多种需求,除了具有一般水稻的特性之外,还兼具功能成分可以调节人体的各项机能。因此,开展水稻功能性营养品质研究,挖掘相关QTL/基因,对利用分子手段培育水稻新品种具有重要意义。本研究以108份水稻材料组成的自然群体为试验材料,对抗性淀粉、
近年来,有众多的学者对Weyl型定理从不同角度进行了研究,不断丰富Weyl型定理.本论文对Bananch空间上有界线性算子的Weyl型定理的相关内容进一步进行探讨.本论文共有四章内容.
干旱半干旱区陆气相互作用对区域气候乃至全球气候和大气环流变化有重要影响,能量平衡问题是在研究地气相互作用过程中不容忽视的问题。本文利用“内蒙古微气象观测蒸发试验
2012年,Samet等人提出了一种新的α弱压缩条件,证明了不动点的存在性。其后,Mursaleen等人将其进行推广,获得了耦合不动点的存在性结果。本文在前人所做工作之上,结合弱压缩映像特
泛态射的定义是Samuel在其研究自由拓扑群时提出的[25].目前泛态射已成为元数学观点中的一个基本要素[32].许多数学结构都可以用泛态射的语言来描述.本文绪论部分介绍了本论
预应力混凝土双T板具有传力路径明确、受力性能好等优势,是应用范围最广泛的预制混凝土构件之一,可广泛用作楼板、屋面板和外墙板,为大跨度工业和民用建筑的首选。在应用双T板的结构中,端部连接节点是传力的核心部位。双T板端部连接方式种类繁多,但在我国的楼盖应用中缺少构造简单且性能优良的连接方式。本文在总结国内外双T板端部连接方式的应用现状基础上,针对我国双T板肋窄和端部配筋构造复杂的实际情况,参考国外现有