猪瘟病毒(Classical swine fever virus，CSFV)E2囊膜糖蛋白是猪瘟病毒的主要结构蛋白之一，是猪瘟病毒中和抗体的主要靶标，是抗猪瘟病毒感染的主要保护性抗原，因此，猪瘟病毒E2蛋白是开发猪瘟新型疫苗、诊断试剂及研究猪瘟病毒致病机理的重要靶蛋白。本研究在不改变编码氨基酸序列的前提下，将猪瘟病毒石门株E2基因进行密码子优化，将其DNA序列优化成G、C含量较高的哺乳动物细胞偏嗜性序列。将人工合成的密码子优化的全长E2基因和去掉跨膜区的E2基因分别克隆到真核表达载体pcDNA3.1(+)中，构建成重组质粒pcDoptiE2和pcDoptiE2delTMR，体外瞬时表达试验证实，目的基因可以在转染的293T细胞中得到表达。将纯化后重组质粒pcDoptiE2、pcDoptiE2delTMR和野生型E2基因(未经过密码子优化)的真核表达质粒pcDwtE2按100μg／只的剂量免疫家兔三次，每次间隔3w，三免后pcDoptiE2delTMR免疫兔平均抗体阻断率达到47.03％，用猪瘟兔化弱毒攻毒后平均抗体阻断率升高到78.24％，体温有一过性升高；而pcDoptiE2和pcDwtE2免疫组经三次免疫后均无明显抗体升高(抗体阻断率低于30％)，仅在攻毒后抗体水平有所升高。研究结果表明，密码子优化且不含跨膜区的猪瘟病毒E2基因DNA疫苗pcDoptiE2delTMR在兔体内免疫效果明显，而同样经过密码子优化全长E2基因的DNA疫苗pcDoptiE2和未经密码子优化的DNA疫苗pcDwtE2在家兔体内未能诱导可检测的免疫应答。本研究探讨了通过对猪瘟病毒E2基因序列进行密码子优化来开发新型猪瘟核酸疫苗的可行性，以及跨膜区对E2基因DNA疫苗免疫效果的影响。