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目的：通过检测急性白血病(acute leukemia, AL)儿童和对照组儿童中亚甲基四氢叶酸还原酶(methylenetetrahydrofolate reductase, MTHFR)基因多态性,了解其等位基因频率和基因型分布特点,探讨基因多态性与AL、急性淋巴性白血病(acute lymphoblastic leukemia, ALL)和急性髓细胞白血病(acute myeloid leukaemia, AML)易感性的关系；回顾性分析ALL患者使用大剂量甲氨蝶呤(high-dose methotrexate, HD-MTX)化疗期间的临床资料,探讨MTHFR基因多态性对ALL儿童使用HD-MTX化疗后毒副反应的影响。方法：从109例AL(87例ALL和22例AML)儿童的骨髓及120例正常儿童的外周血中提取总RNA,逆转录聚合酶链式反应(reverse transcriptase-polymerase chain reaction, RT-PCR)制备cDNA,采用变性梯度凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis, DGGE)结合DNA测序技术,对全部标本进行MTHFR基因编码区单核苷酸多态性(coding-region single nucleotide polymorphism, cSNPs)筛查与鉴定。用X2检验或Fisher’s精确概率法比较各组间MTHFR各基因型及等位基因频率分布的差异,采用非条件Logistic回归模型计算比值比(odds ratio, OR)及95%可信区间(confidence intervals, CI),用经年龄、性别校正的OR和95%CI表示各基因型与AL、 ALL和AML发病风险的相关性。按照美国国立癌症研究所常规毒性判定标准(national cancer institute-common toxicity criteria, NCI-CTC)对52例化疗组患儿HD-MTX化疗后的不良反应进行统一评价,采用上述统计方法分析MTHFR各单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)对HD-MTX化疗后发生毒副反应影响的差异。结果：1.全部229例标本中MTHFR677T等位基因总频率为31.9%,在对照组、AL组、ALL组和AML组T等位基因频率分别为30.8%、33%、34.5%和27.3%,等位基因分布频率在AL组、ALL组和AML组分别与对照组之间的分布差异无统计学意义(P＞0.05)。但各基因型的分布差异有统计学意义(P值分别为0.015,0.044和0.038)。在AL组和AML组中,677CT杂合突变型相对于野生型677CC其疾病发病风险分别降低了2倍和3.9倍(OR=0.492,95%CI=0.267～0.906,P=0.023;OR=0.257,95%CI=0.076～0.868,P=0.029),差异有统计学意义。2. MTHFR1298C等位基因总频率为16.8%,在对照组、AL组、ALL组和AML组等位基因频率分别为15.4%、18.3%、19%和15.9%,等位基因分布频率及各基因型在AL组、ALL组和AML组分别与对照组之间的分布差异无统计学意义(P>0.05),A1298C基因多态性与儿童AL、ALL、AML的易感性无显著相关(P>0.05)。3. MTHFR1793位点A等位基因总频率为7.9%,在对照组、AL组、ALL组和AML组等位基因频率分别为7.1%、8.7%、9.2%和6.8%,等位基因分布频率及各基因型在AL组、ALL组和AML组分别与对照组之间的分布差异无统计学意义(P＞0.05),G1793A基因多态性对白血病发病的风险不存在显著相关性(P＞0.05)。4.本次研究汉族儿童的MTHFR1793A等位基因频率分布与伊朗人、德国犹太人、非裔美国人、奥地利人及巴西人的差异具有统计学意义(P<0.05)。1793各基因型与国外的伊朗、德国犹太人、奥地利及巴西人群的差异具有统计学意义(P<0.05)。5. MTHFR的此3个cSNP位点各基因型在标危(standard-risk, SR)、中危(medium-risk, MR)和高危(high-risk, HR)各临床分组中分布差异无统计学意义(P>0.05)。相对于AA野生型,1298AC基因型个体发生血小板减少的风险提高了13.72倍(OR=13.72,95%CI=1.183～159.364,P=0.036)。而C677T和G1793A各基因型发生各类化疗毒副反应差异无统计学意义(P＞0.05)。6.C677T、A1298C和G1793A位点各基因型在标危+中危(SR+MR)组(MTX应用剂量均为2.0g/m2)和高危(HR)组(MTX应用剂量为5.0g/m2)两组间分布差异无统计学意义(P＞0.05)。但血小板减少和血红蛋白降低发生的差异具有统计学意义(P＞0.05)。这3个SNP位点在SR和HR(MTX应用剂量均为2.0g/m2)中各位点基因型分布及其发生各类HD-MTX临床相关毒副反应的差异无统计学意义(P＞0.05)。结论：1. MTHFR基因C677T位点碱基变异可能是儿童AML遗传易感因素。2. MTHFR A1298C多态性可能与ALL患儿HD-MTX化疗后血小板减少的毒副反应相关。3. MTHFR G1793A基因多态性分布具有种族差异性。