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水稻是世界上最主要的粮食作物,全球约有一半人口以稻米为主食。株高是水稻品种的重要农艺性状之一,矮秆水稻品种的选育和推广是20世纪水稻育种工作的重大成就,因此,矮生基因的发掘研究和利用备受重视。本研究从粳型亲籼系M22—3—1中分离得到一个水稻矮生突变体M22—3—2。突变体平均株高大约为68cm,是野生型的75%,其表现为叶片直立,多分蘖。对突变体进行了遗传分析,同时,利用分离群体对突变体携带的新矮生基因进行了精细定位研究,对基因候选区域进行了筛选。主要研究结果如下:
⑴为了研究M22—3—2的矮生性遗传,将其与半矮秆籼稻品种明恢63、高秆籼稻品种南特号进行了杂交。杂种F1分别表现半矮秆和高秆性状,与明恢63杂交F2群体中的半矮秆和矮秆个体的分离比例符合3:1分离比:与南特号杂交F2群体中的高秆、半矮秆和矮秆个体分离比例符合9:6:1分离比,表明该突变体是由2对隐性矮生基因控制的矮秆材料,其中一对为sdl,另一对与sdl非等位,暂命名为sdm。选取由突变体和南特号杂交的F1与突变体回交,BC1F1群体的分离情况证实了sdm基因的半矮秆化效应。利用SSR标记,把sdm基因定位在水稻第12染色体SSR标记RM1261和RM1986之间,与它们的遗传距离分别为6.8cM和2.7cM。定位结果表明sdm与同一染色体上的矮生基因d33不在同一区域,sdm是一个新矮生基因。sdm基因初步定位区间中的BAC序列进行了SSR序列搜索,并设计了43对引物,结果获得了4个多态性标记。根据大分离群体表型及多态性标记基因型,本研究把sdm基因定位在SSR标记PSM855和PSM881之间,与它们的遗传距离分别为0.6cM和1.0cM。
⑵不同品种对激素(赤霉素GA和油菜素内酯BL)响应应试验结果表明,突变体材料M22—3—2对GA和BL都有响应。由于突变体材料携带半矮秆基因sdl,其对GA响应比较敏感,sdm对GA的敏感性难以判断,需要建立一个排除sdl基因干扰的sdm近等基因系以进一步试验。BR响应试验结果表明,仅携带sdl的半矮秆品种对BL几乎没有响应,而突变体对BR响应比较明显,表明sdm基因对BR敏感,可能与突变体的BR合成或响应有关。
⑶SSR标记PSM855和PSM881分别位于AL731888和AL713900两个重叠BAC克隆上,进一步利用这两个BAC克隆构建了sdm基因的物理图谱。矮生基因sdm被定位在大约152kb的区域内,包含40个预测基因,其中一个细胞色素P450家族基因CYP71E1作为本研究的候选基因。对sdm基因的进一步克隆与功能分析将有助于我们更深入地了解水稻矮化的分子机制。