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油菜在我国是具有传统优势的重要油料作物。油菜产量、品质性状及其他重要农艺性状的遗传基础解析一直是育种家们研究的重点方向。传统的双亲作图群体及自然群体在油菜优质基因发掘及遗传分析中已有广泛应用。MAGIC群体,即多亲本高代互交群体(Multi-parent Advanced Generation Inter-cross),是近年来发展起来的新一代遗传作图及育种群体,目前还没有关于其构建和利用的报道。本研究利用SSR标记对一个包括545个株系的甘蓝型油菜MAGIC群体进行了群体遗传多样性分析及遗传距离聚类分析;在此基础上选取了由204个株系组成的MAGIC子群体,利用60K基因芯片对其进行了群体连锁不平衡分析和品质性状的关联分析。主要研究结果如下:1.用60对SSR标记分析MAGIC的遗传多样性,共扩增261个等位基因,平均每个位点4.35个。每个标记扩增到的等位基因数为2~8个不等,其中扩增等位基因数为4的标记占比最大,为38.33%。SSR标记的PIC值均值为0.48。2.MAGIC群体亲本间、系群间以及系群内遗传距离分析发现,亲本间遗传距离>系群间遗传距离>系群内遗传距离。基于全局遗传距离分析的结果,从每个系群中筛选出遗传距离总和为系群内最大的3~4株系组成一个包含204个株系MAGIC子群体进行后续试验。3.采用60K芯片对MAGIC子群体及8亲本进行基因型分析。在剔除杂合率大于20%的SNP 10979个以及MAF小于0.05的SNP位点5997个后,将剩余下的SNP位点比对到甘蓝型油菜参考基因组上,得到染色体位置清晰的16583 SNP。4.用上述16583 SNP对MAGIC子群体进行遗传多样性的分析发现,全基因组范围内,SNP的PIC均值为0.40,其中A基因组PIC均值为0.39,C基因组PIC均值为0.41,略高于A基因组,PIC>0.3的SNP有12785个,占总标记数的77.1%。5.对MAGIC群体的连锁不平衡分析发现,从整体来看,MAGIC群体中r2衰减到0.20的物理距离约为4Mb。亚基因组A和C的LD衰减情况有明显差异。其中,亚基因组A衰减速度较亚基因组C快,亚基因组A物理距离~700 Kb,r2衰减到0.2,~2.1 Mb,r2衰减到0.1;而亚基因组C上,r2衰减到0.2的距离为6.6 Mb,~7.7 Mb时r2达到0.1。6.关联分析共鉴定到17个与芥酸含量相关的SNP,A8位点峰值SNP Bn-A08-p12814556离Bna A.FAE1只有385 Kb;鉴定到18个与种子硫甙含量相关SNP,其中位于A9染色体上的峰值SNP Bn-A09-p3453706距硫甙基因Bna A.HAG1仅186 K-b,能解释硫甙表型变异的30%。鉴定到43个与棕榈酸、油酸及亚油酸含量相关的SNP,全都位于A8染色体上,其中3个SNP与棕榈酸含量有关,34个SNP与油酸含量有关和5个SNP与亚油酸含量有关。