长鬣蜥GH基因cDNA及部分内含子的克隆测序与序列分析

来源 :华南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wjln123456
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
生长激素(GH)是由动物脑垂体前叶嗜酸性细胞合成和分泌的一种单链蛋白质类激素,具有广泛的生理作用。本研究应用RT-PCR、RACE、克隆测序等技术首次克隆得到长鬣蜥(Physignathus cocincinus)GH基因全长cDNA及第2、3、4内含子序列,并对其序列结构、氨基酸组成以及蛋白质性质进行了初步分析,对今后爬行动物GH基因的结构、表达调控、基因多态性及其与寿命、生长速度、生产性能相关性、进化等方面的研究起着促进作用。主要研究结果如下: 1.首先利用RT-PCR技术扩增得到长鬣蜥GH基因部分cDNA序列。然后再设计引物,用RACE方法获得5’、3’末端cDNA序列,拼接后获得全长为908bp的cDNA序列。经分析:长鬣蜥GH基因mRNA序列包括62bp的5UTR,651bp的ORF,195bp的3UTR,编码216个氨基酸。根据得到的长鬣蜥生长激素cDNA序列设计引物,扩增得到第2、3、4三个内含子序列,长度分别为2700bp、622bp、1278bp。 2.应用生物信息学对长鬣蜥GH基因全长cDNA序列以及编码的氨基酸序列进行分析表明,长鬣蜥GH基因编码区碱基序列与乌龟、鸡、鹌鹑的同源性依次为76%、76%、75%;氨基酸序列与同属于爬行动物的绿海龟、乌龟、鳄鱼的同源性达79%、77%和76%;其次,与鹌鹑、鸡、鸵鸟和鸭的同源性分别为77%、74%、74%、73%,在分子进化上十分保守;其碱基序列的同源性与氨基酸序列的同源性基本一致。 3.通过Clustal X排列,用UPGMA法构建了26种脊椎动物GH基因的分子进化树,发现:长鬣蜥与同属于爬行动物的乌龟处在同一分支上且与鹅、鸭、鹌鹑、鸡、鸵鸟、火鸡进化距离较近,逐次与哺乳动物(山羊、绵羊、牛、马、狗、猪、人、兔、小鼠、褐鼠)、两栖动物(蝾螈、非洲爪蟾、牛蛙)、鲟鱼聚为第一大类;第二大类中斑马鱼与草鱼首先聚为一类,然后逐次与大马哈鱼、鳗鲡聚为一类。 4.长鬣蜥GH蛋白质分子质量约为24,787.53 Da,等电点pI为8.16,第13个氨基酸位置有一个最大的疏水性位点,分值为3.033,并存在明显的跨膜区域。该肽链信号肽位置为1—28,断裂点位置是28—29(TRA—LP)。从而得出,长鬣蜥GH的氨基酸包括长度为28个氨基酸的信号肽和188个氨基酸的成熟肽。
其他文献
石磺科(Onchidiidae)隶属软体动物门(Mollusca),腹足纲(Gastropoda),肺螺亚纲(Pulmonata),缩眼目(Systellommatophora),石磺总科(Onchidioidea);该科贝类身体柔软无贝壳,其出肉率很高,广泛分布于
放暑假前,我一直想去天涯(ya)海角。8月6日,爸爸告诉我说:“今天,我们去三亚。”我很激动,我又可以在火车上睡觉了。爸爸说,我们的火车要“坐”轮船过海。 本文为全文原貌 未安装PDF浏览器用户请先下载安装 原版
期刊
介绍一种利用PN结作为温度传感器,采用三段加热实现的水温测控系统。具有温度测量准确、控制精度高、超调量小的特点,是一种较实用的水温测控系统。 This paper introduces a ki
人各有所爱,有人爱松树,因为它四季常青;有人爱梅花,因为它傲(ao)雪独秀;有人爱奇花异草,因为它世间少有。而我却爱柳树,尽管人们说它弱(ruo)不禁(jin)风,但它表现出了春的柔
期刊
本实验以凡纳滨对虾(Litopenaeusvannamei)为研究对象,在饲料中分别添加0、0.1%、0.2%、0.3%和0.4%的甘露寡糖(MOS),养殖8周后取样检测对虾的免疫功能以及免疫相关基因的表达量;另一
陈老师与我们相处两年了。他很喜欢我们,我们很尊敬他。一直以来,我们多次打听陈老师的生日,他总是一笑而过,一点也不肯透露。这次,终于有同学弄来了准确可靠的消息。 本文为全文原貌 未安装PDF浏览器用户请先下载安装
期刊
本文数据来源于2011年7-9月在西北太平洋公海对秋刀鱼资源进行的海上调查。利用采集到的数据,对西北太平洋公海秋刀鱼脊椎骨的生物学特性进行初步的研究;利用的西北太平洋公海
我在院子里栽了很多树,树上结满了各种各样的水果:有苹果、梨、桃子、香蕉……别看这些大树长得那样粗壮,它们可是我上个月刚栽的呀!我运用了最新的科学技术,让这些小树苗只用了三天。 本文为全文原貌 未安装PDF浏览器用户请先下载安装
期刊
请欣赏,男声小合唱:  “我们是金刚,我们是金刚,正义的保护神,正义的保护神,一定要把坏人消灭消灭消灭——干净!” 本文为全文原貌 未安装PDF浏览器用户请先下载安装 原版全文
期刊
期刊