白色念珠菌快速鉴定方法的临床应用研究

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目的随着有创操作、外科手术的广泛开展以及抗菌药物、免疫抑制剂的大范围使用,免疫低下人群不断增加,导致白色念珠菌血症发病率、病死率逐年升高。而传统的白色念珠菌血症病原学诊断方法耗时较长,较难满足临床及时救治患者的需求,亟需快速方法来鉴定白色念珠菌。本研究采用模拟白色念珠菌血培养阳性样本,以Vitek2 Compact全自动细菌系统鉴定方法为参照,对比分析PNA-FISH技术、MALDI-TOF MS技术鉴定白色念珠菌的符合率、时效性与成本效益,以探讨上述两种快速方法的临床应用可行性。方法1、回顾性分析2017年1月至2021年12月昆明市第一人民医院门诊及住院部各临床科室念珠菌血症的病原菌分离情况,以及临床分布特征,以了解本院念珠菌感染现状。2、复苏白色念珠菌ATCC 14053、热带念珠菌ATCC 750、光滑念珠菌ATCC 15126,克柔念珠菌ATCC 14243、金黄色葡萄球菌ATCC 25923、表皮葡萄球菌ATCC 12228、粪肠球菌ATCC 29212、大肠埃希菌ATCC 25922、肺炎克雷伯菌ATCC 700603、铜绿假单胞菌ATCC 27853等10株标准菌株和临床分离白色念珠菌100株。用复苏菌株,通过BACT/ALENT3D-240全自动血培养系统,将其制备成模拟血培养阳性样本。3、用达安基因公司提供的PNA-FISH探针序列对模拟血培养阳性样本进行PNA-FISH方法直接检测目标念珠菌;同时先将模拟血培养阳性样本转种沙保弱平板培养18-24小时,分离出单个新鲜菌落,采用MALDI-TOF MS进行鉴定;比较PNA-FISH方法和MALDI-TOF MS方法与Vitek 2 Compact全自动细菌系统鉴定白色念珠菌的符合率,分析上述两种快速鉴定方法的的时间效益和鉴定成本。结果1、2017-2021年我院住院及门诊共送检血培养标本38338份,阳性标本2265份,剔除同一患者血培养中分离的重复菌株,检出真菌28株,血培养阳性率为5.91%,真菌分离率为0.07%。其中,2017年真菌分离率最高,占0.11%,2019年真菌分离率最低,占0.03%。2、2017-2021年阳性血培养中分离非重复真菌28株,其中念珠菌属25株(89.29%),新型隐球菌3株(10.71%)。血培养阳性分离念珠菌中,以白色念珠菌为主,检出12株(48%),其次是光滑念珠菌5株(20%)、都柏林念珠菌4株(16%)、近平滑念珠菌2株(8%)、热带念珠菌1株以及未鉴别到种水平的念珠菌属1株,均占4%。3、念珠菌血流感染患者年龄分布,以80~99岁高龄患者为主,有10例占40%;其次是60~79岁老年患者5例,占20%;40~59岁患者9例,占36%;0~19岁患者1例,占4%。4、念珠菌血症患者科室分布,重症监护室最多,有12例(48%),其次分别来自泌尿外科5例(20%)、老年病科3例(12%)、肾内科2例(8%),其余分布于消化内科、肝胆胰外科、心胸外科,均为1例(4%)。5、采用VITEK 2 Compact全自动细菌鉴定仪YST卡鉴定念珠菌,25株念珠菌的平均鉴定时间为43.03±21.82小时,12株白色念珠菌的平均鉴定时间为40.98±14.81小时。6、念珠菌血症患者25例,以该病为首要病因的死亡患者12例,致死率达48%;白色念珠菌血流感染患者12例,以该病为首要病因的死亡患者6例,致死率达50%。7、100株白色念珠菌模拟血培养样本,PNA-FISH检测结果与Vitek2 Compact全自动细菌鉴定方法符合率为98%,平均鉴定时间为2.5±0.5小时,每个标本鉴定成本约为60元。8、100株白色念珠菌模拟血培养样本,转种沙保弱平板分离出单个新鲜菌落,采用MALDI-TOF MS鉴定。结果显示,MALDI-TOF MS鉴定100株白色念珠菌最低分值为2.008,平均分值为2.191,均能准确鉴定到白色念珠菌种水平及以上,和Vitek2 Compact全自动细菌鉴定方法的符合率达100%,从血培养报阳开始计算鉴定时间,平均鉴定时间为22±0.6小时,每个标本鉴定成本约为30元。结论1、本院念珠菌血症病原菌分布以白色念珠菌为主,致死率极高。2、PNA-FISH方法鉴定白色念珠菌,设备简单,鉴定结果可靠,相较于传统鉴定方法和MALDI-TOF MS方法,鉴定时间显著缩短,有较好的临床应用前景。
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